(3) 起始密码子和终止密码子的选择 ①如果标签蛋白在多克隆位点的前面,载体含有ATG,克隆基因最好从基因的ATG开始(前面5’非编码区的基因会翻译,如果从前面设计引物),这时基因的ATG不能作为起始密码子,只能是翻译成M,因为只有第一个ATG才能作为起始密码子,即标签前面的那个密码子。所以可以从ATG开始设计引物,加上保护碱基,不用加cozak序列。 但是下游引物必须要加上终止密码子。 ②如果标签蛋白在多克隆位点的后面,要看载体有没有自己带起始密码子,如果没有,那么引物要加ATG和cozak序列。 但是下游引物不加终止密码子,加了标签就不表达了。 (4)Kozak序列 存在于真核生物mRNA的一段序列,其在翻译的起始中有重要作用。 核糖体能够识别mRNA上的这段序列,并把它作为翻译起始位点。注意这段序列并不是ribosomal binding site (RBS)核糖体结合位点,而是帽子结构 。 真核生物基因中起始密码子上下游的最佳序列为,-3位为嘌呤碱基;+4位为G,起始密码子AUG中的A处于+1位。A/GCCAUGG被称为kozak序列或扫描序列。 (5) 移码突变-补碱基 如果酶切位点不是整个3个碱基的倍数,就要根据多克隆位点上改酶切位点补足3连体,使ATG前面是三联体,不然会造成移码突变。 ECORI酶切位点 :GAATTC BamHI酶切位点 :GG
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