来自人类排泄物中的属新种-Subdoligranulum variabile.docVIP

来自人类排泄物中的新属新种-Subdoligranulum variabile 摘要 在研究人类排泄物中的菌群时，我们分离出了一个菌种，这个菌种是严格的厌氧的，无芽孢，革兰氏染色为阴性并且呈现多样性的球菌形态。从系统发育看，相对的16S核糖体RNA基因序列研究表明未知的菌群是柔嫩梭菌亚属rRNA簇的一个成员。并且与来自人类和猪的排泄物的一些rDNA表现了密切的关系。和这种已分离未知菌体关系最近的已命名的菌体是Faecalibacterium prausnitzii (以前的Fusobacterium prausnitzii)，并且与Faecalibacterium prausnitzii的16sRNA序列表现出接近9%的分离比，Anaerofilum agile 和 A. pentosovorans与未知的菌体表现了第二亲密的关系（序列分离率接近10%）。基于表型和系统发育的考虑，这个不寻常的球状菌体被归类为一个新的属和种- Subdoligranulum variabile。这个模式菌株S.variabile叫做BIT (=CCUG 47106T=DSM 15176T)。 简介 相对小亚族16S rRNA的系统发育分析改变了我们对于人类肠道微生物多样性的认识。尽管长期以来我们认为人类胃肠道是由大量的多样性厌氧细菌构成的，但是随着独立培养研究的到来，尤其是16S rDNA群落的分析