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- 2017-06-07 发布于重庆
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PCR室菜鸟培训手册
PCR室菜鸟培训手册
实时荧光定量PCR的定量方法有两种:一种是绝对定量;另一种是相对定量。
①绝对定量:就是我们分子室每天做的工作(HBV,HCV,CT/UU/TB/HSV…),绝对定量的测定结果准确,但需要目的片段的标准品,通过绘制标准曲线来计算出测定结果。
②相对定量:(在通常情况下,并没有目的片段的标准品,为了计算出一个值,就必须采取相对定量的方法,这也是实验研究常采取的方法之一)。相对定量需要借助一个内参基因(像β-action,GAPDH…起空白的作用)作比对,以间接计算出目的基因的测定值。其计算公式如下:
△Ct Ct(目的基因)-Ct(管家基因)
△△Ct △Ct(实验组)-Ct(对照组)
相对表达量 2-△△Ct
PCR结束后,一个良好的扩增曲线会有如下特征:
①曲线拐点清楚,特别是低浓度样本曲线指数期亦明显;
②扩增曲线整体平行性好,其平行性一定程度上反应定量结果的重复性好坏;
③基线平直或略微下降,无明显上扬趋势,阴阳分界清楚;
④扩增曲线整体平行性好,表明各管扩增效率相近,曲线越上扬明显,表明扩增效率越好。
PCR基本术语和概念(以绝对定量为例):
Baseline(基线):PCR最初几个循环的荧光值作背景值。
Threshold(阈值):一条人为设定在PCR指数增长期的直线。
Ct值:每条荧光扩增曲线与所设定的阈值(Threshold)相交时对应的循环次数
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