我国高校基因研究状况和实力分析-浙江大学农业与生物技术学院.docVIP

我国高校基因研究状况和实力分析 屠友金 李安华 （浙江大学，杭州 310029） 随着人类基因组测序的完成，基因研究（所谓功能基因组研究）成为新的研究热点，各国都投入大量人力和物力开展相关研究。我国作为六个人类基因组测序参与国之一，也积极在这一领域开展卓有成效的研究工作，如我国在2001年底又完成了水稻基因组测序的工作草图等。高校历来是我国基础研究的一只重要队伍，为我国的一些重要基础研究项目做出了突出贡献。在基因研究方面，高校也同样扮演着重要角色，他们是我国最早开展基因研究的研究单位之一（具体见正文）。摸清我国高校目前基因研究的现状和实力，对制定和实施切实有效的科研管理政策具有重要意义。 GenBank基因序列数据库是世界上最主要的公共数据库之一，它与欧洲的EMBOL和日本的DDBJ基因数据库统称为国际公共数据库，它们接受并储藏有世界上几乎所有科学机构和个人提交的DNA序列，同时这三个数据库之间每天都交换各自接受来的序列记录。 本文通过检索和分析GenBank数据库中有关我国和我国高校递交的核苷酸和基因组序列记录数，获得了我国高校基因研究的一个整体状况，同时比较了各主要高校间的研究实力。 一、数据来源和统计方法 本文统计了截止1996年12月31日和2001年12月31日由我国大学和其他研究机构直接递交GenBank国际公共数据库的DNA和基因组序列数量，有关统计说明如下： 1、数据来源 GenBank基因序列数据库（），由美国生物技术信息中心（NCBI）维护。通过INTERNET登陆方式检索和下载相关数据。限定统计了两个时间点：Limited 1996/12/31和2001/12/31 2、统计方法 利用NCBI提供的ENTREZ搜索系统进行初步的检索和统计： 先将只要含有中国、台湾、香港和澳门字样的非EST记录均下载： 检索策略为： (CHINA OR TAIWAN OR “HONG KONG”) NOT gbdiv est[Properties] Limits: Modification Date to 2001/12/31，共获得24701个记录 (CHINA OR TAIWAN OR “HONG KONG”) NOT gbdiv est[Properties] Limits: Modification Date to 1996/12/31，共获得915个记录 自编程序并对上述记录分别在记录的“JOURNAL”字段后（“SUBMMIED:….”）进行中国大陆、台湾和香港数据库记录的统计和国内一些主要城市及高校数据库记录的统计等。 EST（表达序列标签）记录数据是通过ENTREZ 检索GenBank数据库“gbdiv est”子库获得的。 （3）各高校的英文名称均通过INTERNET上各高校的主页查找得来，通过教育部网站获得了我国所有院校合并的信息，在统计时按合并后的高校组成统计。检索中对我国主要的高校均进行了统计，然后进行排名。另外，除了特别说明外，文中的记录均指非EST核苷酸序列记录。 其他几点说明：（1）如果递交给GenBank数据库的记录中没有“China”、“Taiwan”、“Hong Kong”和“Macao”等字样，而仅注明“PROC”、“PRC”等则不包括在本研究统计范围；（2）在进行高校检索时，仅包括记录中直接出现“University”一词的记录。本研究的原则是不对记录进行任何修订，如果记录中“University”一词输入错误或没有写明具体大学（而实际是由某一大学完成的），将均被排除在外。以上两种情况在本研究的记录中均存在，但仅涉及极少数记录；（3）对中国大陆的检索策略是在有“China”字样的记录中剔除含有“Taiwan”、“Hong Kong”字样的记录来实现的。统计中注意了台湾和香港递交的记录中对“China”一词使用不规范的一些情况。 二、我国高校基因研究整体状况 总体情况 表1 中国高校核苷酸序列（非EST）记录总数和所占比例情况 统计截止日期 地区 记录总数（非EST） 其中高校记录数 % 1996-12-31 大陆 180 58 32.2 台湾 464 288 62.1 香港 55 51 92.7 澳门 0 0 2001-12-31 大陆 10879 4194 38.6 台湾 6039 3738 61.9 香港 1399 1335 95.4 澳门 0 0 截止2001年12月31日，中国高校向国际公共数据库GenBank直接递交的核苷酸序列记录（非EST）总数为9267个，各地区所占比例分别为大陆地区45.3%、台湾40.3%和香港14.4%，澳门目前在数据库中还没有记录；大学递交的记录平均占整个