蛋白质降解及氨基酸代谢 蛋白质降解 细胞外降解 细胞内降解 不依赖于ATP的降解途径 发生在溶酶体 依赖于ATP的降解途径 i) N-端规则和“PEST” 序列 ii)需要泛素 iii)降解发生在蛋白酶体 iiii) 高度调控 N-端规则 一种蛋白质的半衰期与N-端氨基酸的性质有关。 如果一种蛋白质N端的氨基酸是 Met, Ser, Ala, Thr, Val或Gly,则半衰期较长,大于20个小时。 如果一种蛋白质的N端氨基酸是Phe, Leu, Asp, Lys或 Arg ,则半衰期较短,3分钟或者更短。 PEST蛋白 富含Pro (P), Glu (E), Ser (S)和Thr (T) 序列的蛋白质质被称为PEST 蛋白, 它们比其他蛋白质更容易发生水解。 泛素 泛素广泛存在于古细菌和所有的真核生物,但不存在于真细菌。 它由76个氨基酸残基组成,是一种高度保守的蛋白质。 在三维结构上,泛素则是一个结构紧密的球蛋白,但其C-端四肽序列(Leu-Arg-Gly-Gly)离开蛋白主体伸向水相,这有助于它与其它蛋白质形成异肽键。 泛素本身并不降解蛋白质,它仅仅是给降解的靶蛋白打上标记,降解过程由26S蛋白酶体执行。 泛素是一种热激蛋白 蛋白酶体 20S核心颗粒,形状如桶,为大的多功能蛋白酶复合物,降解细胞内多聚泛酰化的蛋白质 19S帽状调节颗粒 ,负责识别泛酰化的蛋白质,并将它们去折叠以及输送到CP的蛋白酶活性中心。 氨基酸代谢 1. 氨基酸降解 1) 氨基的去除 脱氨基 i) L-氨基酸氧化酶 ii) D-氨基酸氧化酶 iii) 谷氨酸脱氢酶 转氨基 联合脱氨基 2) 碳骨架的命运 生酮氨基酸和生糖氨基酸 3) 氨基的排泄和解毒 2. 氨基酸合成 转氨基反应 转氨基反应是指一种氨基酸的氨基被转移到一种α-酮酸的酮基上形成一种新的氨基酸和一种新的α-酮酸的过程。催化此反应的酶被称为转氨酶。转氨反应是完全可逆的,因此它既参与氨基酸的降解,又参与氨基酸的合成。 转氨酶有多种,但是每一种转氨酶都需要磷酸吡哆醛作为辅基,而且绝大多数转氨酶以谷氨酸作为氨基的供体或者以α-酮戊二酸为氨基的受体。 并不是所有的氨基酸都可以发生转氨基反应,Thr, Pro, lys是例外。 C 骨架的命运 生糖氨基酸:其他 生酮氨基酸: Leu Lys 生酮兼生糖氨基酸: Trp, Thr, Tyr, Ile, Phe (tttip) 铵离子的命运 直接排出体外 植物将其转变成Asn (Asn合成酶) 动物将其转变成Gln (Gln合成酶) 尿素或尿酸 N的命运 尿素循环 尿素是通过尿素循环产生的,它发生在哺乳动物的肝细胞。尽管参与尿素循环的个别酶还发现在其它组织,但完整的尿素循环仅存在于肝细胞。肝外组织氨基酸分解产生的氨主要通过Gln运输到肝细胞,但肌肉蛋白分解产生的Ala可经血液循环进入肝细胞。此外,在细胞内合成NO的反应中,精氨酸转变成瓜氨酸,后者是尿素循环的中间物。瓜氨酸需要重新转变为精氨酸,以补充被消耗的精氨酸,因此,在使用NO作为信号分子的细胞中含有足够的与尿素循环相关的酶,以维持细胞内精氨酸的供应。 尿素循环的调节 别构调节 N-乙酰谷氨酸对CPS-1的别构激活,控制了尿素产生的总速率。 参与尿素循环各种酶浓度的变化 底物浓度的积累诱导酶的表达;产物的积累抑制酶的表达。 氨基酸的生物合成 植物和微生物在有合适的N源时能够从头合成所有的20 种标准氨基酸。而哺乳动物只能制造其中的10种,这10种氨基酸被称为非必需氨基酸,其余10种氨基酸必需从食物中获取,被称为必需氨基酸。 任何氨基酸合成的前体都来自于糖酵解、TCA循环或磷酸戊糖途径,其中N原子通过Glu或Gln进入相关的合成途径,而合成的场所有的在细胞液,有的在线粒体。 按照各氨基酸合成前体的性质,所有的氨基酸可分为5大家族 。 必需 vs 非必需氨基酸 Thr Ile Phe Met Trp Val His Arg Lys Leu Ala Asp Asn Cys Glu Gln Gly Pro Ser Tyr 尿素循环 五大氨基酸家族 Tip MTV Hall * * N-端氨基酸与蛋白质半寿期之间的关系 约3分钟 约2分钟 Leu,PHe,Asp,Lys Arg 约7分钟 Pro 约10分钟 Tyr,Glu 约30分钟 Ile,Gln 去稳定的氨基酸残基 20个小时 稳定性氨基酸残基: Met,Gly,Ala,Ser,Thr,Val 半寿期(half-time
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