Chapter 7 翻译
当40S小亚基扫描5’UTR时,能够破坏这一区域的二级结构(发卡),但非常稳固的发卡结构会妨碍甚至组织小亚基迁移。 当遇到起始AUG时,小亚基停下来。 通常,但不总是遇到的第一个AUG就是起始密码子,不过仅凭这个AUG自身不足以阻止小亚基迁移,只有当它处于正确的上下文(context)时,才能作为起始密码子被有效地识别。 当起始AUG处于 NNNPuNNAUGG 这样的环境时,可以被识别。-3位的嘌呤(A或G)和+4位的G,对翻译效率影响很大,可达10倍。(Kozak序列,Kozak sequence) 当前导序列很长时,在第一个亚基脱离起始位点之前,可其它亚基识别5’帽子结构,这样在5’帽子和起始位点之间,各亚基排队。 多数能高效率翻译的mRNA上的第一个AUG往往是起始密码子。但如果不是,核糖体可能通过渗漏(直接通过扫描至下一个,因其不处在正确的上下文);有时识别这个AUG,但在正确的AUG前终止翻译,再接着扫描。 大多数真核生物翻译起始事件涉及扫描,但也有采取其它形式的,特别是某些病毒RNA,其小亚基直接结合在一个称作IRES(内部位点)。IRES的同源性不强,据其与40S小亚基的结合,已鉴别出三类: 一种是IRES包括位于其上游边界的AUG 起始密
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