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1第一章4蛋白质化学
肽键的特点: 共价键,具有共轭性 原子共处于一个平面(肽平面,酰胺平面) 肽平面:由组成肽键的四个原子能及相临的两个Cα组成的平面 具有百分之40双键的性质,旋转构象受到限制 以反式结构出现 二、蛋白质的一级结构 (重点) AA在多肽链中的排列顺序。最小单位为氨基酸。 具体内容: ①AA的顺序(成键方式,氨基酸种类,氨基酸数目) ②肽链的数量级 ③二硫键的数量,位置 二硫键(disulfide bonds) 肽链中相应部位上的两个半胱氨酸残基脱氢连接而成,是连接肽链内和肽链间的主要桥键。 在蛋白质分子中起着稳定肽链空间结构的作用,与生物活性有关。 一般数目越多,蛋白质结构越稳定。 生物体内起保护作用的角、皮、毛发的蛋白质中二硫键最多。 三、蛋白质的空间结构 (重点) 蛋白质的空间结构通常称为蛋白质的构象(高级结构),是指蛋白质分子中所有原子在三维空间的排列分布和肽键的走向。 空间结构是一级结构为基础的。 二级结构 多肽链的主链在空间螺旋,折叠而成 氢键在链内或链间作用,导致二级结构出现α-螺旋 β-折叠 β- 转角,自由加转 (五)超二级结构(supersecondary structure) 与结构域(structural domain)(过渡态) 超二级结构:在球状蛋白质中,由相邻的二级结构单元组合,相互作用,形成有规则的αα,ββ,αβα,βββ,βαβ,空间上可辨认的二级结构组合体,充当三级结构的构件。 结构域:在超二级结构基础一进一步螺旋,折叠,组装成几个相对独立的三维实体。近似球状的结构,只具有部分生物功能。 结构域与功能域的关系: 对于小分子多肽链pro结构域即为三级结构(功能域) 对于大分子多肽pro通常几个结构域构成三级结构 蛋白质的三级结构: 定义:多肽链上的所有原子在三维空间的分布, 球状pro 具亲水性 在二级基础上,侧链间的作用 作用力:次级键(弱键), 主要有盐键、疏水键、氢键、范德华力 蛋白质的四级结构: 指两条或多条肽链以特殊方式结合成为有生物活性的蛋白质。 两条多肽链以上的pro具有四级结构,肽链之间在空间上相互作用(非共同键)形成的称为寡聚蛋白。 该种肽链就称为该蛋白质的亚基。 四、蛋白质分子中的共价键与次级键 (重点) 共价键(一级结构):肽键、二硫键 次级键(高级结构):氢键、疏水键、盐键、范德华力 一级结构化学键:肽键(键内共价键),二硫键(链间共价键)——桥键 二级结构化学键:氢键 三级结构化学键:氢键,疏水键,盐键,范德华力 四级结构化学键:范德华力,盐键 第五节 蛋白质的性质 一 、蛋白质的分子大小 (了解掌握) 二 、蛋白质的两性离解和电泳现象 (重点) 三 、蛋白质的胶体性质(了解掌握) 四 、蛋白质的沉淀作用(重点) 五 、蛋白质的变性(重点) 六 、蛋白质的紫外吸收(了解掌握) 七 、蛋白质的颜色反应(了解掌握) 一 、蛋白质的分子大小 (了解掌握) 蛋白质的分子量 104-106……107 分子量的测定方法: 1.沉降渗析法(超离心法) 2.凝胶过滤法 3.SDS一聚丙烯酰胺凝胶电泳法 4.质谱法 5. 渗透压法 分子量测定方法: 1.沉降渗析法(超离心法60000-80000转/分):根据pro颗粒的沉降系数S,扩散系数D ,R:气体常数,T:绝对温度,V:溶质特异性体积, ρ :溶剂密度 M=RST/[D(1-Vρ)] 2.凝胶过滤法:计算收集到的洗脱液的体积。 V=k + clogM 3.SDS一聚丙烯酰胺凝胶电泳法:pro在电泳中的迁移速率。 d=k + clogM 4.质谱法:利用高能带电粒子将pro从一金属支持物上释放出来 5. 渗透压法: M=cRT/Π 6. 光散射法:M=τ/Hc 二 、蛋白质的两性离解和电泳现象 (重点) 蛋白质的等电点 定义:当溶液在一定pH值的环境中,使蛋白质所带的正电荷与负电荷恰好相等,即总净电荷为零,在电场中,蛋白质分子既不向阳极移动,也不向阴极移动,此时溶液的pH值称为蛋白质的等电点。 pI与分子中的酸碱性氨基酸的比例有关。 在等电点时,蛋白质的溶解度最小,其它性质如粘度、渗透压及膨胀性等也都是最小。 没有相同电荷相互排斥的影响,因此最不稳定,溶解度最小。 极易借静电引力结合成较大的聚合体,沉淀析出。 电泳:蛋白质颗粒在电场的移动现象 移动速率,方向与蛋白质颗粒的带电性,电荷数 量,颗粒大小有关 应用于pro制备,分离,纯化 自由临界电泳:蛋白质溶解于缓冲液中通电。 区带电泳:蛋白质溶液点在浸了缓冲液的支持物上进行电泳,不同组分形成带状区域。 凝胶电泳:以凝胶(淀粉、琼脂、聚丙烯酰胺)作为支持物的电泳。 纸上电泳:以滤纸作为支
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