第一章 蛋白质的结构及功能
第一节 氨基酸与多肽
一、氨基酸的结构与分类
(一)氨基酸的一般结构式
氨基酸是组成人体蛋白质的基本单位,共有20种,除甘氨酸外均属L-a-氨基酸。氨基酸的一般结构式为NH2—CH(R)—COOH。连在COOH基团上的C称为a—碳原子,不同氨基酸其侧链(R)各异。
(二)氨基酸分类
体内20种氨基酸按理化性质分为4组:①非极性、疏水性氨基酸;②极性、中性氨基酸;③酸性氨基酸;④碱性氨基酸
分 类 氨基酸名称 非极性、疏水性氨基酸 甘氨酸(Gly)、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸(Phe)、脯氨酸 极性、中性氨基酸 色氨酸(Trp)、丝氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr),半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苏氨酸(Thr) 酸性氨基酸 天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu) 碱性氨基酸 赖氨酸(lys)、精氨酸(Arg)、组氨酸(His) 生糖兼生酮氨基酸 苏氨酸(Thr)、色氨酸(Trp)、苯丙氨酸(Phe)、异亮氨酸、酪氨酸(Tyr) 记忆:(俗色本已漏) 含硫氨基酸 半胱氨酸、胱氨酸、蛋氨酸
二、肽键与肽链
氨基酸分子之间通过去水缩合形成肽链,NH2—CH(R)—CO—NH—CH(R)—COOH在相邻两个氨基酸之间新生的酰胺键称为肽键,肽键具有一定程度双键性质。若许多氨基酸依次通过肽键相互连接,形成长链,称为多肽链。
三、氨基酸的两性解离
PHPI 阳离子; PH=PI 兼性离子; PHPI 阴离子。
四、紫外吸收
色氨酸(Trp)、酪氨酸(Tyr)最大吸收峰值在280nm。
第二节 蛋白质的结构
一、蛋白质的一级结构
多肽链中氨基酸的排列顺序称为蛋白质的一级结构,肽键是维系一级结构的化学键。蛋白质分子的一级结构是其特异空间结构及生物学活性的基础。
二、蛋白质的二级结构
蛋白质的二级结构是指局部或某一段肽链主链的空间结构,即肽链某一区段中氨基酸残基相对空间位置,它不涉及侧链的构象及与其它肽段的关系。α-螺旋、β-折叠、β-转角是二级结构的主要形式之一,其结构特征如下:①多肽链主链围绕中心轴旋转,每隔3.6个氨基酸残基上升一个螺距;②每个氨基酸残基与第四个氨基酸残基形成氢键。氢键维持了α-螺旋结构的稳定;③α-螺旋为右手螺旋,氨基酸侧链基团伸向螺旋外侧。
三、蛋白质三级和结构
蛋白质的三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,即整条肽链的三维空间结构。三级结构的形成和稳定主要靠疏水键、盐键、二硫键、氢键等。许多(并非所有)有生物活性的蛋白质由两条或多条具有三级结构的肽链构成,每条肽链被称为一个亚基,通过非共价键维系亚基与亚基之间的空间位置关系,这就是蛋白质的四级结构。各亚基之间的结合力主要是疏水键,氢键和离子键也参与维持四级结构。
一级结构 二级结构 三级结构 四级结构 定义 氨基酸的排列顺序 蛋白质主链的局部结构 整条肽链中全部氨基酸残基的排列 各亚基之间的空间位置 表现形式 肽链 α-螺旋、β-折叠、β-转角 结构域、分子伴侣 亚基 维系键 肽键 氢键 疏水作用、氢键、范德华力、离子键 氢键、离子键
第三节 蛋白质结构与功能关系
一、蛋白质的一级结构和功能的关系
一级结构是空间构象的基础,也是功能的基础。一级结构相似的蛋白质,其空间结构及功能也相近。若一级结构发生改变影响其功能,称为分子病。
二、蛋白质的高级结构和功能的关系
蛋白质的空间结构与功能由密切的关系,若蛋白质的折叠发生错误,尽管其一级结构不变,但蛋白质的构象发生改变,仍可影响其功能,严重时导致疾病称为蛋白质构象疾病。
第四节 蛋白质的理化性质
蛋白质的变性
在某些理化因素的作用下,蛋白质的空间结构(但不包括一级结构)遭到破坏,导致蛋白质若干理化性质和生物学活性的改变,称为蛋白质的变性作用。
蛋白质变性后,其溶解度降低、粘度增加、结晶能力消失、生物活性丧失,易被蛋白酶水解。
引起蛋白质变性的常见理化因素有:加热、高压、紫外线、X射线、有机溶剂、强酸、强碱等。球状蛋白质变性后其溶解度降低,容易发生沉淀。
第二章 核酸的结构和功能
第一节 核酸的基本组成单位—核苷酸
一、核苷酸分子组成
核酸也称为多核苷酸,是由数十个以至数千万计的核苷酸构成的生物大分子,也即核酸的基本组成单位是核苷酸。核苷酸分子由碱基、核糖或脱氧核糖和磷酸三种分子连接而成。碱基与糖通过糖苷键连成核苷,核苷与磷酸以酯键结合成核苷酸。核酸中含量相对恒定的元素是氮。
参与核苷酸组成的主要碱基有5种。属于嘌呤类化合物的碱基有腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G),属于嘧啶类化合物的碱基有胞嘧啶(C)、尿嘧啶(U)和胸腺嘧啶(T)。
二、核酸(DNA和RNA)
几个或十几个核苷酸通
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