基因组作图软件GenomeDiagram.docxVIP

第17章 Graphics模块中的基因组可视化包—GenomeDiagramBio.Graphics?模块基于Python的第三方扩展库?ReportLab?，ReportLab主要生成PDF文件，同时也能生成EPS（Encapsulated Postscript）文件和SVG文件。ReportLa可以导出矢量图，如果安装依赖关系（Dependencies），比如?PIL(Python Imaging Library)，ReportLab也可以导出JPEG, PNG, GIF, BMP和PICT格式的位图(Bitmap image)。17.1 基因组可视化包—GenomeDiagram17.1.1 GenomeDiagram简介Bio.Graphics.GenomeDiagram?包被整合到Biopython 1.50版之前，就已经是Biopython的独立模块。GenomeDiagram包首次出现在2006年Pritchard等人在Bioinformatics杂志的一篇文章 [:ref:`2 pritchard2006`] ，文中展示了一些图像示例，更多图像示例请查看GenomeDiagram手册?/DIST/docs/GenomeDiagram/userguide.pdf?。正如“GenomeDiagram”名称所指，它主要用于可视化全基因组(特别是原核生物基因组)，即可绘制线