毛竹PIF类转座子的克隆和结构分析以及MLE转座子对毛竹基因组多态性的影响.pdfVIP

摘要 摘要 尸不稳定因子伊instabilityfactor，胛夕是首先在玉米里发现的一类DNA类转 座子，后来将结构相似、同源同类型的DNA转座子归类到一个新的家族，命名PIF 类转座子。肼类转座子结构由2个开放阅读框(ORF)，TIR序列和TSD序列组成。 Mariner-Like element(MLE)是自主转座子Tcl—mariner超家族中一个重要家族。其结构 由位于转座子两端的末端颠倒重复序列(Tm)，2个TIR中间的编码转座酶的结构 域，转座子插入新位点时引起靶序列产生的TA重复序列(TSD)三部分组成。胛 类转座子和具有结构简单、转座子在基因组插入位点接近随机和异源转座率高这三个 特点的MLE转座子，成为近几年研究的热点。 本研究首次通过基于磁珠富集的染色体步移法从毛竹中分离到一个全长肼类 转座子(砌尸2：FJ)。砌MF_7长5953bp，它有20bp不完整的末端反向重复序列 (TerminalInveaed Repeats，TIRs)和3bp靶位点重复(Target Site Duplications，TSDs)， 砌P限_7转座子也含有2个开放阅读框(Open Reading Frames，ORFs)，其中一个编码假 定转座酶，具有来自植物基因组PIF／Harbinger家族典型的完整DDE结构域，另一个 开放阅读框编码DNA结合蛋白，在这个ORF中含有7个终