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- 2016-08-23 发布于江苏
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七、PCR技术在临床检验中的应用 1、在常见病原体检测中的应用: HBV-DNA、HCV-RNA、EB-DNA、HCMV-DNA、MP-DNA、UU-DNA、CT-DNA、HSV2-DNA、NG-DNA 2、分子遗传学研究:基因变异、表达、重组、进化等 3、医学诊断:遗传病、基因病、癌变、代谢性遗传病等 4、法医学鉴定 5、组织器官移植配型:HLA-SSP配型 学习动物精神 11、机智应变的猴子:工作的流程有时往往是一成不变的,新人的优势在于不了解既有的做法,而能创造出新的创意与点子。一味 地接受工作的交付, 只能学到工作方法 的皮毛,能思考应 变的人,才会学到 方法的精髓。 学习动物精神 12、善解人意的海豚:常常问自己:我是主管该怎么办才能有助于更好的处理事情的方法。在工作上善解人意, 会减轻主管、共 事者的负担,也 让你更具人缘。 * Tm 值就是 DNA 熔解温度, 指把 DNA 的双螺旋结构降解一半时的温度 * PCR技术及应用 分子生物学诊断组 江杨华 2016年3月25日 星期五 PCR的定义 PCR的原理 PCR反应体系的的成分及其作用 PCR反应体系的优化 PCR技术的特点 PCR产物的检测方法 PCR技术在临床检验中的应用 一、PCR的定义 PCR(polymerase chain reaction) : 聚合酶链式反应,又称体外DNA扩增技术。是近年来发展起来的一种体外扩增DNA片段的技术。 PCR技术是由美国 的Kary Mullis 于1985年发明,用此方法可以将微量目的DNA片段扩增一百万倍以上。由于PCR方法带来的革命性作用,Kary Mullis 本人因此获1993年诺贝尔化学奖。 二、PCR技术的原理 PCR技术,其原理是模拟天然DNA的复制过程:以拟扩增的DNA分子为模板,在DNA聚合酶的作用下,以一对分别与模板5′末端和3′末端互补的引物(寡核苷酸片段)引导下,按照半保留复制的机制合成新的子链DNA的过程,重复这一过程,即可使目的DNA片段得到不断的扩增。 二、PCR技术的原理 PCR反应主要分为三个步骤:变性、退火、延伸。 1.变性 (Denaturation): 加热使模板DNA双链碱基间的氢键断裂而形成两条单链的过程。温度一般为90-95度。 2. 退火 (复性) (Annealling): 温度降低后,变性后的DNA与引物按碱基配对原则互补结合的过程。温度一般为Tm-5度。 二、PCR技术的原理 3. 延伸 (Extension): 在适宜温度下,在DNA聚合酶作用下,以4种 dNTPs等为 原料,从引物的 3′ 端开始,结合单核苷酸,形成与模板链互补的新DNA链的过程。 耐热DNA聚合酶最适温度为72 ℃。 上述 3 步为一个循环,每经过一个循环,样本中的DNA量就增加一倍,新形成的链又可成为新一轮循环的模板,经过35个循环后,理论上DNA的量可达到235倍。 PCR 的基本反应步骤 变性 95?C 延伸 72?C 退火 Tm-5?C PCR的指数扩增(2n) 引物 5’ 5’ 3’ 3’ 第一次循环 第二次循环 第n次循环 二、PCR技术的原理 1. 缓冲液: 10 ~ 50 mM Tris- Cl (pH8.4): 维持 Taq 酶作用环境的偏碱性 25 ~ 50 mM KCl: 促进引物退火,50 mM 会抑制 Taq 酶的活性。 100μg / ml 牛血清白蛋白 (BSA): 对酶有一定的保护性,如质量不好将起相反的作 用,建议使用乙酰化的 BSA。明胶、Tween-20、 二硫苏糖醇 (DTT) 也有类似作用。 三、PCR反应体系的的成分及其作用 2. MgCl2 : Taq 酶具有 Mg2+依赖性,显著影响反应的特异性和扩增片段的产量,浓度一般为1.5 ~ 2.0 mM,浓度过高能增加非特异扩增并影响产率,过低则酶活性显著下降。 3. dNTPs : dATP、 dGTP 、dCTP、dTTP。浓度一般为0.05 ~ 0.2 mM。 过高能加快反应速度,但可增加碱基的错误掺入 率和室验成本。 过低则反应速度下降,但可提高实验的精确性。 三、PCR反应体系的的成分及其作用 4. 引物 (Primer):是一段寡核苷酸片段,即预扩增核酸片段两端的已知序列。浓度一般为0.2 ~ 1 uM,偏高:非特异产物扩增及错配,增加引物之间形成引物二聚体,产量降低。 偏低:产量降低。 5. Taq DNA 聚合酶:耐高热,最初从火山口细菌中提取,具有连接酶活性和5 ’端至 3’端的外切酶活
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