文献检索精读.pptx

文献检索 生物学常用网站和软件应用 生理教研室 段萍 duanping@ 研究生科研技能学习内容： 科研思维培训 科研技术培训 写作培训 研究生毕业论文的准备 文献检索 综述书写 研究生开题 实验 实验总结、查缺补漏、毕业论文 文献检索 研究生检索文献来源 检索策略举例 检索文献管理（Word + EndNote） 针对开题和综述写作的文献精读 研究生必须检索的文献： 1. 导师发表的文献 2. 导师推荐的文献 3. 高影响因子杂志发表的最新综述 4. 感兴趣的研究方向检索 检索策略举例 中文检索 英文检索 以导师名进行检索 检索策略举例 中文检索 英文检索 检索文献管理 EndNote Office Word EndNote ⑴EndNote 是SCI（Thomson Scientific 公司）的官方软件，支持国际期刊的参考文献格式有3776 种，写作模板几百种。 ⑵EndNote 能直接连接上千个数据库，并提供通用的检索方式，为您提高了科技文献的检索效率。 ⑶EndNote 能管理的数据库没有上限，至少能管理数十万条参考文献。 ⑷EndNote 快捷工具嵌入到Word 编辑器中，您可以很方便地边书写论文边插入参考文献，书写过程中您不用担心插入的参考文献会发生格式错误或连接错误。 ⑸EndNote 的系统资源占用小，很少发生因EndNote 数据库过大发生计算机死机现象，这是EndNote 最重要的特色之一。 EndNote安装 建立Library（图书馆） 在线模式搜索pubmed1. PMID号搜索 在Word中插入参考文献 2. 利用文献title等信息搜索 在网站google学术中插入 中文文献导入EndNote 利用谷歌学术 利用中国知网 利用Word记录文献笔记 针对研究生开题和综述写作的文献精读 哪些文献需要精读？ 1. 导师推荐文献 2. 感兴趣的高影响因子文献 3. 与自己的课题紧密联系的文献 SCI影响因子 SCI(Science Citation Index)是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库。 SCI(科学引文索引)、EI(工程索引 )、ISTP(科技会议录索引) 是世界著名的三大科技文献检索系统，是国际公认的进行科学统计与科学评价的主要检索工具，其中以SCI最为重要。 精读方法 文章组成： Abstract Introduction Materials and methods Results Discussion References 生物学常用网站 常用功能： 文献查找及全文链接 基因查找、基因注释、相关数据库链接 PCR引物设计 基因查找、基因注释、相关数据库链接 GenBank是美国国立卫生研究院维护的基因序列数据库，汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列。 访问GenBank。/ （1）mRNA 记录（NM_*）: e.g.:NM_000492 （2）基因组的DNA重叠群（NT_*）: e.g.:NT_000347 （3）完整的基因组或染色体（NC_*）: e.g.:NC_000907 （4）基因组的局部区域（NG_*）: e.g.:NG_000019 （5）从人类基因组注释、加工得到的 序列模型（XM，XP，or XR_*）： e.g.:XM_000483 特殊标志符的格式（核酸序列）： RefSeq（Reference Sequence）序列接受号: 应用UCSC/Ensembl查找基因启动子(promoter)、内含子、外显子序列 FASTA格式 第一行是以符号（）打头的任意文字说明。 第二行开始时序列本身。每一行不超过80个字母 PCR引物设计 向公司提交PCR引物订单 引物设计软件 已报道的PCR引物验证 引物设计软件 primer premier5 Oligo7.37 /Blast.cgi GEO数据库 为了支持公共使用和散布基因表达数据，NCBI开始了基因表达汇编（GEO）计划。GEO是努力建立一个基因表达数据仓库和在线资源，用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。来自microarray，高密度寡核苷酸array（HAD），杂交膜（filter）和SAGE的许多类型的基因表达数据都被接受，登记，和存档，作为一个公共数据集合。一系列预先计算的数据的定义和描述，以及用于交互检索和分析这些表达数据的在线工具即将放入。