转录组实战第三讲之测序质量评估和reads回贴精读.pptxVIP

长非编码RNA测序分析实战讲解之测序质量评估和Reads回贴 卜德超 budechao@ 中国科学院计算技术研究所 2014-12-20 概要 长非编码RNA测序介绍 一个测序实例 长非编码RNA分析流程 步骤一详解：Reads质量评估 步骤二详解：基因组比对 附录：运行命令 长非编码RNA测序介绍 一个测序实例 长非编码RNA分析流程 步骤一详解：Reads质量评估 步骤二详解：基因组比对 附录：运行命令 长非编码RNA测序 长非编码RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）是一类长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs 长非编码RNA测序：通过测序技术，获得某个物种或特定细胞在某一生理条件下产生的所有的长非编码RNA 想测长非编码RNA，提取RNA的步骤是怎样的？ 转录组内的RNA 转录组RNA，按功能分类： mRNA 非编码RNA（即Non-coding RNA，如 tRNA，rRNAs，microRNAs，piRNAs 和lncRNAs等） 转录组内的RNA, 按polyA形态： 带polyA的RNA (mRNA和大部分的lncRNA) 不带polyA的RNA (小RNA和小部分的lncRNA)??????? 长非编码RNA测序 总的RNA(200) 去掉rRNA后的RNA 不带polyA的RNA 带polyA的RNA polyA富集 总的