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ibm服务器用户使用说明
IBM服务器用户使用说明
1. 集群介绍
整套集群由四部分组成：Power 720管理登录节点+5台Power 755计算节点(128进程/台)+10台Intel Xeon系列计算节点(24进程/台)+DS5020存储系统。
2. 作业管理
Power 755计算节点是IA64结构，Intel Xeon计算节点是X86_64结构。整套集群安装了两套作业管理软件：IBM LoadLeveler和 PBS(Torque)。LoadLeveler用来管理Power 755计算节点上的作业，Torque用来管理Intel Xeon系列计算节点上的作业。
2.1 LoadLeveler
在Power 755这些节点上可以运行的软件有：Gaussian，Gamess，molcas和molpro.
2.1.1 Gaussian 版本Gaussian 09, Revision B.01
1. 编写作业卡，文件名 (文件后缀一定为com)
2. 提交命令：$q09 NPP jobname (NPP代表并行进程数，jobname为作业文件名，不需后缀)
例如： $q09 16 au2 (它将为作业分配16个并行进程，作业结束后生成结果文件au2.out)
3. 如不记得输入参数，可提交命令$q09, 它会出现Usage: q09 NPP jobname!
4. 由于计算结点上最大为128进程，并且Gaussian并行效率不高，因此希望在试运行期间提交作业NPP设为8, 16, 32, 64 为好。
5. Gaussian的临时区设在/gpfs/scratch中, 该区文件随时可能清空。
2.1.2 Gamess 版本GAMESS VERSION = 1 OCT 2010 (R3)
1. 编写作业卡，文件名jobname.inp (文件后缀一定为inp)
2. 提交命令：$qgms NPP jobname (NPP代表并行进程数，jobname为作业文件名，不需后缀)
例如： $qgms 16 au2 (它将为作业au2.inp分配16个并行进程，作业结束后生成结果文件au2.log)
3. 如不记得输入参数，可提交命令$qgms, 它会出现Usage: qgms NPP jobname!
4. 由于计算结点上最大为128进程，因此希望在试运行期间提交作业NPP设为8, 16为好。
5. Gamess的临时区设在/gpfs/scratch中, 该区文件随时可能清空。
2.1.3 Molpro 版本Molpro Version 2010.1 linked 17 Jun 2011 12:31:42
1. 编写作业卡，文件名jobname （可不用后缀）
2. 提交命令：$qmolpro jobname (jobname为作业文件名)
例如： $qgms au2 (它将为作业au2分配进程，作业结束后生成结果文件au2.out)
3. 如不记得输入参数，可提交命令$qmolpro, 它会出现
Usage: qmolpro jobname!
4. 由于AIX编译问题，目前只能运行单进程作业。
2.1.4 Molcas 版本Molcas Version version 7.4 patch level 045
1. 编写作业卡，文件名jobname.input （可不用后缀）
2. 提交命令：$qmolcas NPP jobname (NPP代表并行进程数，jobname为作业文件名，不需后缀)
3. 如不记得输入参数，可提交命令$qmolcas, 它会出现Usage: qmolcas NPP jobname!
4. 由于计算结点上最大为128进程，因此希望在试运行期间提交作业NPP设为8, 16为好。
2.1.5 其它程序作业投交方式
以上程序简单命令方式都是通过编写合适脚本由llsubmit 提交，其它程序可参见以上脚本写出，具体可见路径 /home/apps/bin
2.1.6 监控作业和结点状态及取消作业命令
通过llstatus命令可以查看服务器节点使用情况，类似于我们经常使用的shownodes和pbsnodes，示例如下：
查看运行作业要使用llq命令：
例如： llq –u user 可以看到用户user作业情况
如果要取消某个作业，要使用llcancel命令，类似于我们使用过的qdel命令。
例如： llcancel 2092 (将2092号进程取消)
试用期队列规则如下：?1.?使用队列：?:?时间限制天；默认队列；?????????2.?作业数限制： ????????每用
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