实习4蛋白质结构与功能预测分析.ppt

* Center跨膜中心区，50以上比较好 +可信度，++很可信 Score * * 横—氨基酸残基位置。 实线高，可能 红色是跨膜区， * * * * 加edu的邮箱 分析跨膜区 Rel是对第二行的打分结果，0.9，分值高可信度高 N是非跨膜区 * * InterPro 是一个整合的包含以下的 * * * 脂肪系数—针对于球蛋白 总平均亲水性—负值越多越亲水 7跨膜 结果返回到邮箱 邮箱 蛋白质 分析选项，可能选默认 一般采用默认值 MaxHom参数选项 比对算法，一般选择默认 采用默认值 低复杂区域 二硫键预测 可以选择返回到邮箱 选项都选 蛋白质家族的信息 越在里面越大，外面越细 下图红表示本家族 未知蛋白采用--串线法 同源建模精度高90% 蓝色是建模区域 1.94A是精度 H a螺旋 S b折叠 绿色柱子代表能量，越低越好 甘氨酸例外 Picture View 其他数据库中的AC号 保守区示意图 ID名 InterPro蛋白家族信息 AC号，家族名称 家族蛋白 其他数据库中的收录情况 相关的其他家族 条目类型 InterPro蛋白家族信息 生物体内的信息 说明 结构链接 数据库链接 InterPro蛋白家族信息 该家族蛋白在不同种类生物体中出现情况 其他家族与该家族的重叠情况 * 练习四：InterProScan http://www.ebi.ac.uk/I