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第1章 生物化学基础 1、一句话问题 生命形式虽然千差万别，在就化学本质而言，他们具有一致性。 生命体区别于非生命体的四个基本特征。 有机体遵行热力学第一定律，通过增大环境的无序而使得自身有序化。 生命体的信息流基本类同。 根据SSU RNA序列细胞分为三类，细菌、古细菌和真核细胞。古细菌与真核细胞更接近。 线粒体和叶绿体是通过内共生进入真核细胞。线粒体来源于紫细菌，叶绿体来源于蓝细菌。 细胞与细胞器--超分子复合体 大分子--单体 生物分子结构决定反应性、结构决定功能、结构也代表一种信息。 细胞内是一个水环境，水为细胞内生化反应提供了反应介质，甚至直接参与反应。 第2章 氨基酸与肽 概念 蛋白氨基酸:参与蛋白质组成的20种氨基酸。 非蛋白氨基酸：不参与蛋白质的组成的氨基酸。 兼性离子 ：既有带负电荷基团，又有带正电荷基团的离子称为兼性离子或两性离子，亦称偶极离子。 pI （等电点）：在一定PH值时，氨基酸以兼性离子形式存在，此时该离子所带的静电荷为零，在电场中不会向正负极移动，此时溶液的PH称为该离子的等电点。不同结构的两性离子有不同的等电点。 pI= 1/2 (pK1’ +pK2’) 酸性Aa pI= 1/2(pK1’ +pKR’) 碱性Aa pI= 1/2(pK2’ +pKR’) Paralogues 并系同源物：一个个体中既有一定关系却又不相同的蛋白质。 orthologues 直系同源物：具有相同功能的蛋白质 写出20中氨基酸的三字母和单字母缩写，哪些属于酸性，哪些属于碱性，哪些含羟基，哪些含硫元素。 （1）中性氨基酸： 1、glycine 甘氨酸 Gly G 2、alanine 丙氨酸 Ala A 3、valine 缬氨酸 Val V 4、leucine 亮氨酸 Leu L 5、isoleucine 异亮氨酸 Ile I (2)含羟基或巯基氨基酸 6、 serine 丝氨酸 Ser S 7、threcnine 苏氨酸 Thr T 8、 cysteine 半胱氨酸 Cys C 9、methionine 甲硫氨酸 Met M ? ? (3)酸性氨基酸及其酰胺 10、aspartate 天冬氨酸 Asp D 11、glutamate 谷氨酸 Glu E 12、ASPARAGINE 天冬酰胺 Asn N 13、glutamine 谷氨酰胺 Gln Q ? ? ? （4）碱性氨基酸 14、lysine 赖氨酸 Lys K 15、arginine 精氨酸 Arg R 16、histidine 组氨酸 His H 17、proline 脯氨酸 Pro P ? ?? ? ? （5）芳香族氨基酸 18、phenylalenine 苯丙氨酸 Phe P 19、tyrosine 酪氨酸 Tyr Y 20、tryptophan 色氨酸 Trp W ?? ? ??? 氨基的化学反应: ◆与茚三酮 (ninhydrin) 的反应 定量反应 ◆与亚硝酸的反应 Van Slyke定氮 ◆与2,4-二硝基氟苯 (FDNB) 的反应 测序 ◆与甲醛的反应 氨基滴定 ◆与酰化基的反应 氨基保护基 ◆与二甲基氨基萘磺酰氯 (DNS-Cl)的反应 测序 ◆与荧光胺的反应 微量检测 ◆与Edman试剂 (苯异硫氰酸酯)反应 测序 与茚三酮反应：氨基酸脱羧脱氨被氧化，水合茚三酮被还原，氧化型和还原型的水合茚三酮与氨反应生成二酮茚-二酮茚胺的取代盐等蓝紫色化合物。 二甲基氨基萘磺酰氯 (DNS-Cl，Dansyl chloride)，目前用于蛋白质微量测序的主要试剂。 4-(N,N-二甲基氨基)偶氮苯-4‘-磺酸氯 ?Dabsyl chloride 什么是sanger反应 在弱碱性溶液中，氨基酸的α-氨基很容易与2，4-二硝基氟苯作用，生成稳定的黄