遗传图构建原理作业答题.pptVIP

遗传图构建原理 ————遗传学 人 类 基 因 组 计 划 结构基因组的研究策略 由此可知： 遗传图的绘制是人类基因组研究的第一步。 遗传图 什么是遗传图？ 怎样构建遗传图（即遗传图的构建原理）？ 遗传图的发展历史？ 构建遗传图的功能、意义？ 一、遗传图谱的相关定义 遗传图（genetic map）： 又称为连锁图（linkage map），是指基因或DNA标志在染色体上的相对位置与遗传距离，后者通常以基因或DNA片段在染色体交换过程中的分离频率厘摩（图距单位：cM）来表示，cM值越大，两者之间距离越远。 遗传距离： 减数分裂时两个基因间重组值为1% 连锁图中两个基因间图距1厘摩 1cM大约相当于1×106个核苷酸对（1Mb）. 一、遗传图谱的相关定义 遗传标记： 遗传标记是遗传物质的特殊的易于识别的表现形式,可以是任何一种呈现孟德尔遗传的性状或物质形式，如：基因、血型、血清蛋白、DNA多肽标记等，确定其在基因组中的位置后，可作为参照标记用于遗传重组分析，研究基因遗传和变异的规律。 目前, 遗传标记主要分4 大类: ① 形态学标记 主要指可以观察到的一些性状, 如种皮颜色、抗病性反 应、株高等。 ② 细胞学标记 主要包括核型分析、染色体分带和原位杂交技术、利用非整体进行遗传操作进而基因定位等。 ③ 生化标记 主要是同工酶及种子贮藏蛋白, 有时又称做蛋白质标记或当做一种分子标记。 ④ 分子标记 主要指在DNA 水平上的标记。 任何一类图谱都有可识别的标记。遗传图谱的标记是什么呢？ 遗传作图的常用标记 1.基因是首先被使用的标记 在经典遗传学中，研究一种性状的遗传必须要求同一性状至少2种不同的存在形式或称表型。 起初只有那些能通过视觉区分的基因表型用于研究。最初的遗传图谱是在20世纪初针对果蝇等生物使用基因作为标记构建的。 2. DNA标记 基因之外的作图工具统称为DNA标记。有三种类型的DNA序列特征可以满足这一要求： 1.限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphisms, RFLP） 2.简短串联重复 short tandem repeats, STR 3.单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNP） 二、遗传图构建理论 遗传作图 Genetic mapping 即遗传图谱的构建。它是利用遗传学的原理和方法，构建能反映基因组中遗传标记之间遗传关系的图谱。 孟德尔遗传定律： 等位基因随机分离 如果亲本的等位基因是A和a，那么F1代的成员得到A或a的概率相等。 非等位基因自由组合 基因A的等位基因遗传与基因B的等位基因遗传相互独立。 连锁与部分连锁： 20世纪初遗传学家认识到基因位于染色体上，同一染色体上的两个基因理论上应该共同传递给下一代。但事实上同一染色体上的完全连锁的想象只有极少数。大多数的基因是部分连锁的。 摩尔根用减数分裂时染色体的行为解释了同一染色体上的基因部分连锁的现象。 部分连锁的原因是基因之间发生了交换 2.1 遗传作图的方法 从摩尔根时代开始，连锁（linkage）分析便成为遗传分析的重要手段，更是遗传作图的基础。遗传标记之间的遗传关系主要是通过连锁关系来反映。而连锁关系是通过重组率来反映的。 重组型数目 重组率 RF ———————— 总数目 遗传作图的理论基础： 假设交换是随机发生的，一对并列的染色单体上任何两点发生交换的机会是均等的； 两个彼此靠近的基因之间因交换而分离的的几率要比互相远离的2个基因之间发生分离的几率要小。 因此重组率可以成为测量两个基因之间相对距离的尺度。 计算出不同基因间的重组率，就可以构建出显示基因在染色体上相对位置的图。 二、怎样构建遗传图 步骤： 1. 选用合适的遗传标记 2. 测定群体中不同个体的遗传标记 3. 对遗传标记数据进行连锁分析，构建连锁图 2.1 传统遗传图 传统遗传图中的遗传标记主要是形态学标记。形态学标记的数量不多，但利用形态学标记作图的时间很长，在二十世的前八十年主要是利用形态学标记作图。 果蝇的突变体: 2.2 分子遗传图 要构建分子遗传图谱首先要根据遗传材料选择合适的作图群体，再应用分子标记技术对基因型进行标记分析，确定标记间的连锁关系。 2.2 分子遗传图 其构建步骤： 主要包括构建合适的遗传群体，包括亲本的选择，分离群体类型的选择及群体大小的确定等；利用合适的分子标记进行分析；利用计算机软件进行图谱构建，建立标记间的连锁排序和遗传距离； 利用计算机软件绘出遗传图谱这几个部分. 不同模式生