GeneMapper ID-X使用.pptVIP

1 1 3 2 显示不同样本的组成个体数 2个个体组成的混合样本分型分析 如果有已知样本,选择是否导入已知样本的位点信息 导入已知分型 从之前导出已知分型的目标盘中导入已知样本的位点信息 2个个体样本组成的混合分型分析界面 混合样本名称 选中的分型 没有选中的分型 通过峰高以及基因型频率计算出主、次要贡献者基因分型 统计学结果 RMP 统计学结果 CPI/CPE 统计学结果 LR 没有已知分型的样本分析 点击“Export”导出混合分析的结果，点击“Finish”关闭混合分析 查看分析后的分析结果 Selected Genotype Combiantions ,适当的时候可以查看原始图谱 Sample Plots 使用Missing Marker检查有没有缺位点,如果没有位点缺失,则导入合适的群体数据,得到统计学计算结果。 Thank You! ? 2010 Life Technologies Corporation. All rights reserved. The trademarks mentioned herein are the property of Life Technologies Corporation or their respective owners For Research, Forensic or Paternity Use Only. Not intended for any animal or human therapeutic or diagnostic use * * * 在GMID v3.2上如果忘记选择的话，会提示样品不符合分析条件，需要查看出错信息。而在GMID-X上，可以通过一个详细的摘要了解分析要求以及参数的选择方面的问题，更加方便修正，进行后续的工作 * * 添加样品到项目中 1、table setting选择3500/31xx data analysis 2、选择好sample typer、analysis method、panel、size standard 分析要求核查，如有不符项则会提示 如图中所示为没有panel、没有ladder Ladder质量核查，如质量不佳会有提示 图中显示，1个ladder质量高，1个质量差 有3个选项，依次是： 至少选择1个质量好的ladder分析； 无视ladder质量继续分析； 查看ladder图谱 完成分析后自动显示Analysis Summary 分析小结 Ladder分析小结 control分析小结 样本分析小结 依次检查内标、信息、原始数据、EPT参数 图谱显示中每个位点均有颜色标记 软件操作展示 GMID-X软件数据比对流程 工作流程 导入Lab Reference and Custom Control Profiles在Profile Manager中查看导入的分型 Examine Sample Concordance Perform Sample Comparison and View Results Perform Lab Reference Comparison and View Results 增加参照样本基因分型 软件自动比对阳性质控是否正确 Reference profile GMID-X混合样本分析流程 工作流程 添加样本，正确分析样本 混合分析准备 建立混合分型的分析方法 Mixture Analysis Method 导入等位基因频率 Population Database 可选择 导出组成混合分型的单一来源个体分型 进行混合分析，分析察看结果 进行统计学计算 导出分析结果 软件自动提示是否存在混合样本 添加样本，正确分析样本 分析并编辑所有的OL，软件无法分析含有OL的样本 建立混合样本分析方法 建立混合分析的分析方法 Tool- Mixture Analysis Manager- Mixture Analysis Methods 建立混合分型的分析方法 输入混合分析的分析方法名称 输入对该分析方法的 描述 根据实验室实际情况合理设定杂合子的峰高比值 PHR 设定混合分析的阈值 保存混合分析方法 输入混合分析的 分析方法名称 导入群体数据 导入群体数据 :\AppliedBiosystems\GeneMapperID-X\Mixture Analysis\Population Databases （可选择）导出有可能组成混合分型的已知基因分型 将“Table Setting”改为“Known Sample Export” 选中需要导出的“Sample”,打开图谱，将“Plot Setting”更改为”Data Interpretation” File- Export