lammps安装指南.docVIP

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lammps安装指南

sudo –I 进入根权限 cd .. 回到上级菜单 输入su root进入不了root,而输入sudo su和sudo -i可以,为什么?这3个命令有什么不同? su root就是一个切换用户命令,root是用户名,那么你需要输入的就是root账户的密码 要用什么root权限做事在前面加sudo就行了 sudo -i选项是指更改shell环境参量为目标用户的,而你没指名目标所以默认了root,并且把环境参量也换成root的了,就更root登录shell一样。 sudo apt-get install g++ -安装fftw? 1下载源码包fftw-2.1.5.tar.gz,解压 tar xvzf fftw-2.1.5.tar.gz? 2 cd fftw-2.1.5.? 3 ./conefigur --prefix=/opt/mathlib/fftw215-gnu --enable-float? ? ?其它选项:? 4 make? 5 make install? 二安装mpich? 1下载mpich.tar.gz? 2 cd mpich-1.2.7**?(版本太低用2.1.5)-- 3 ./configure --prefix=/opt/mpich-gnu? 需要安装gfortran sudo?apt-get?install?gfortran 4 make? 5 make install? 三 编辑/etc/hosts.equiv文件 ,在其中加入本机主机名(用hostname可以得到),单独一行!? 前三步都在root下进行。? 下面的步骤都在自己的用户中进行? 还要安装一个jpegsrc.v8c.tar.gz。否则四中编译运行会说缺少此文件。 cd?jpeg-8c ./configure?--prefix=/opt/jpeg?(配置JPEG库安装路径,请记住,后面需要用到) make make?install 然后再把src/MAKE里面的Makefile.g++文件修改一下 JPG_INC?=???????-I/opt/jpeg/include JPG_PATH?=?????-L/opt/jpeg/lib 安装build-essential软件包 $sudo?apt-get?install?build-essential 再在src目录下,用命令 make?package-status查看一下安装了哪些包 删了后生成lmp_g++可执行文件。 四 安装lammps? 1 tar xvzf lammps.tar.gz? 2 cd lammps**? 3 cd src? 4 vim MAKE/Makefile.g++? ? ? 修改mpich的安装路径? ? ? 修改fftw的安装路径? (每个都有两处,include前面和lib前面的部分)? MPI_INC = -DMPICH_SKIP_MPICXX -l/opt/mpich-gnu/include MPI_PATH = -L/opt/mpich-gnu/lib FFT_INC = -DFFT_FFTW -l/opt/mathlib/fftw215-gnu/include FFT_PATH = -L/opt/mathlib/fftw215-gnu/lib JPG_INC = JPG_PATH = JPG_LIB = -ljpeg (这里是它的jpegsrc.v8c.tar.gz路径) 设置环境变量:在根目录下 然后在你的主文件夹下找到.bashrc文件,在最后加入下面的内容LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich2/lib:/opt/fftw215/lib:/home/sky/tools/lammps/src/lib:$LD_LIBRARY_PATH注意按照你自己的安装路径进行改动。然后用命令source?~/.bashrc进行更新 export LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich2/lib:/opt/fftw215/lib:/home/sky/tools/lammps/src/lib:$LD_LIBRARY_PATH 输入 echo $LD_LIBRARY_PATH 查看环境变量是否应用 source?~/.bashrc 5 make g++ (在src目录下)? 生成lmp_g++? 四 运行lammps? 1 cd ../bench? 2 /opt/mpich-gnu/bin/mpirun -np 16 ../src/lmp_g++ in.chain 谁写的,认领吧,呵呵 试试example里面

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