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蛋白质组学Proteomics
打?的答案表示不确定,没有标记的有些也不确定
第一章
HUGO:人类基因组组织(HUGO) 人类基因组计划(HGP)
HUPO:人类蛋白质组研究组织(HUPO)
基因组学研究的成就、缺陷
1900 孟德尔遗传定律
1913 绘制出第一张线式基因图谱
1929 提出DNA的化学成分和基本结构
人类基因组计划“三大科技计划”
人类基因组计划,( 因其对预防治疗遗传疾病、破解人类遗传密码具有里程碑式的意义 )与曼哈顿原子弹计划、阿波罗登月计划,被称为20世纪的人类自然科学史上三大科学计划。
人类基因组作图的目的:目的是保证人类整个基因组的完整性。都是根据人类社会发展 需要,为了更好的了解人类基因组成与预防某些未知领域的疾 病而做出的图解分析素材。。
遗传图谱、物理图谱、基因组图谱这三个图谱之间的相关性
遗传图谱:采用遗传学分析的方法将基因或其他DNA分子标记在染色体相对位置上构建的连锁图。表示不同基因之间的相对位置,以及不同基因之间的相对距离!
物理图谱:采用分子生物学技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标定基因组的实际位置所构建的位置图。
遗传图谱与物理图谱的共同之处都是确定基因或DNA分子标记在染色体上的排列位置。
基因作图(gene mapping)是一种遗传学作图,用来定位染色体中特定的DNA片段。是基因组研究的成果之一,主要分为以重组率为定位依据的遗传舆图,以及以DNA片段实际位置为依据的物理舆图?
从几个方面看结构基因组学和功能基因组学?
以全基因组测序为目标的结构基因组学和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学。
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蛋白质组学与传统蛋白质化学的区别
蛋白质组学研究与传统蛋白质化学研究不同。传统蛋白质的研究主要针对单个蛋白质。蛋白质组学以细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式为研究对象。(多蛋白质系统)
蛋白质化学包括研究蛋白质的结构和功能,通常涉及物理生物化学或机械酶学,蛋白质组学的内容是系统生物学,而不是结构生物学。
蛋白质化学研究工作通常包括完整序列测定、结构测定以及进行结构控制功能的模型研究;蛋白质组学需进行复杂混合物的分析,通过在数据库匹配工具下进行部分序列的测定。
蛋白质组学研究的目的:确定所有的蛋白质
蛋白质组学与基因组学研究技术上有什么区别?
基因组学 蛋白质组学 环境 静态 动态 数量 少 多 能否扩增 利用PCR扩增 无法扩增 检测技术 利用互补链 抗原抗体结合 对象 唯一 不同实体
蛋白质组学研究的内容分为几个方面?主要哪几个方面,研究内容
蛋白质的分离与鉴定
蛋白质互作或蛋白质复合体分析
蛋白质翻译后修饰研究
蛋白质功能鉴定
蛋白质复合体的结构分析
第二章
蛋白质组学的三大分支:表达蛋白质组学、功能蛋白质组学、结构蛋白质组学表达蛋白质组学研究技术:蛋白质分离技术、质谱分析技术、基因表达的系列分析技术、微测序而技术等
功能蛋白质组学研究技术:生物信息学分析、全基因组的蛋白质标签、基因敲除或删除、酵母双杂交、蛋白质芯片等
结构蛋白质组学研究技术:X射线晶体衍射图谱法(测定晶体中的蛋白质分子构象)、核磁共振法(测定溶液中的蛋白质构象)
蛋白质组学与基因组学的区别。
蛋白质表达水平不能从mRNA表达水平来预测。
蛋白质组与他的状态相对应。
上述区别的根本原因是蛋白质组学研究对象比基因组学研究更复杂,为什么?
数量多、结构更为复杂、是动态反应发育过程
蛋白质的组成及结构比基因更复杂;
蛋白质的数目远大于基因的数目;
基因是相对静态的,生物体中的基因组在不同环境下是相同的,而蛋白质是动态的,随时间、空间的变化而变化。
2-DE技术与
蛋白质组学三大支撑技术:2-DE技术、质谱鉴定技术、图像分析技术
2D-HPLC(多维液相色谱)色谱分离技术的优点,与2-DE的区别。
定义:任何将混合物组分在两相中(固定相和流动相)进行分配的分离技术都被称为色谱。
原理:混合物溶解在同一溶剂中,当流动相流经固定相时 ,混合物组分可以与溶剂以及固定相基质分子间发生作用。
HPLC优点 :(包含区别)
速度快 几个小时可完成全部分离,而2-DE分离一般需要1~2d。
自动化 由于在溶液状态样品处理方便、快速,避免了2DE从胶上回收样品的繁复操作,分析过程易于与质谱联接。
多用途 对各种蛋白质均适用,而2DE对分子量过大(200kD)或过小(10kD)蛋白质不易分离。
1-DE电泳技术的优缺点
优点:
免除了样品从1D胶向2D胶过渡时的繁复操作。
与准确、灵敏、高分辨的质谱鉴定技术相结合,可能发展成2-DE的替代方法之一。
缺点:
1-D
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