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C值悖论
C值悖论
百科名片在每一种生物中其单倍体基因组的DNA总量是特异的,被称为C值(CValue)。 DNA的长度是根据碱基对的多少推算出来的。各门生物存在着一个C值范围,在每一门中随着生物复杂性的增加,其基因组大小的最低程度也随之增加。
目录
简介
C值矛盾的产生
C值与进化
C值与基因组结构
一、基因序列和非基因序列
二、寻找基因的思路:
分子遗传标记发展
SNP分析的特点
定位候选克隆
差异表达
生物信息学方法
cDNA序列测定
简介
C值矛盾的产生
C值与进化
C值与基因组结构
一、基因序列和非基因序列
二、寻找基因的思路:
分子遗传标记发展
SNP分析的特点
定位候选克隆
差异表达
生物信息学方法
cDNA序列测定
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简介
物种的C值与其进化复杂性之间无严格对应关系 C值的资料表明,在不同的门中C值的变化是很大的。相对比较简单的单细胞真核生物象啤酒酵母,其基因组就有1.75×10^7bp大约是细菌基因组的3-4倍。最简单的多细胞生
C值悖论
物秀丽隐杆线虫其基因组有8×10^7bp,大约是酵母的4倍。看来生物的复杂性和其DNA含量之间有较好的相关性。但我们可看到在其它的一些门中,这种相关性有的并不现在。实际上一个门中的C值变化并没有一定的规律。例如在哺乳类、鸟类和爬行类的C值变化范围都很小,而在两栖类中这种变化范围增大,而植物的C值变化范围更为宽广,常成倍成倍地增加。C值和生物结构或组成的复杂性不一致的现象称为C值悖论 C-value paradox 。现在我们还不能完全解释这种矛盾。在一定意义上说,生物类群中C值变化范围宽就意味着在某些生物中有些DNA是冗余的,不能编码有功能的活性物质。DNA总量变化范围的产生至少有一个原因,即在染色体上存在着不同数目的重复序列,这些重复序列是不表达的。 第一,生物体的高等还是低等并不能光光从染色体的多少或者DNA的多少来衡量,而应该看他们的有用基因的数量。因为染色体中很多内含子、junkDNA和重复序列在目前的研究看来对生物的性状是不必要的。 第二,从哲学的角度,生物并不能被分为高等和低等,这种划分是人为的划分,但在自然选择的角度下来看,所有地球上的生物都是平等的,没有高低等之分。
C值矛盾的产生
一个基因组中的DNA含量用C值表示,C值的大小并不能完全说明生物进化的程度和遗传复杂性的高低。也在计算C值时是根据所有的表达产物来估计的。比如3000个氨基酸就是1000个mRNA,就是2000个DNA,而实际上还有非编码的,所以少估计了。 高等生物具有比低等生物更复杂的生命活动,所以,理论上应该是它们的C值也应该更高。但是事实上C值没有体现出与物种进化程度相关的趋势。高等生物的C值不一定就意味着它的C值高于比它低等的生物。这种生物学上的DNA总量的比较和矛盾,称为C值悖论。
C值与进化
物种的C值与其进化复杂性之间无严格对应关系。C值的资料表明,在
C值悖论
不同的门中C值的变化是很大的。相对比较简单的单细胞真核生物象啤酒酵母,其基因组就有1.75×10^7bp大约是细菌基因组的3-4倍。最简单的多细胞生物秀丽隐杆线虫其基因组有8×10^7bp,大约是酵母的4倍。看来生物的复杂性和其DNA含量之间有较好的相关性。但我们可看到在其它的一些门中,这种相关性有的并不现在。实际上一个门中的C值变化并没有一定的规律。例如在哺乳类、鸟类和爬行类的C值变化范围都很小,而在两栖类中这种变化范围增大,而植物的C值变化范围更为宽广,常成倍成倍地增加。C值和生物结构或组成的复杂性不一致的现象称为C值悖论 C-valueparadox 。现在我们还不能完全解释这种矛盾。在一定意义上说,生物类群中C值变化范围宽就意味着在某些生物中有些DNA是冗余的,不能编码有功能的活性物质。DNA总量变化范围的产生至少有一个原因,即在染色体上存在着不同数目的重复序列,这些重复序列是不表达的。
C值与基因组结构
基因组大小、基因数目与生物复杂度的关系也是科学家们关注的一个重要问题。基因组大小也称为C值,是指生物体的单倍体基因组所含DNA总量。从原核生物到真核生物,C值变化很大。但是基因组及其生物的复杂度与C值之间并不一定线性相关,如变形虫的C值是人的200倍。这就是所谓的C值悖论。这种差异主要来源于非编码序列的多少。目前对为什么有的基因组非编码序列多,有的则很少还没有明确的解释。有人怀疑非编码序列与基因组的可塑性有关。与此相关的一个问题是基因数目与生物体的复杂性是否有关?这个问题引起了对G gene 值的讨论。现在已经发现,一些生活史相似的近缘物种基因数不同。例如,支原体病菌中的Mycoplasmapneumonia的基因组中包括的基因数比M.genital
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