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十项必修技能操作步骤
仅供参考,具体以各实习指导老师要求以及考核大纲为准!
1、质粒DNA提取
实验用品:试剂盒,Ep管,离心机,恒温箱,菌液
流程:
1.将小管中的菌液分批次倒入对应编号的Ep管中,离心13,000rpm ,2min ,弃上清(最后一次在纸上扣干)
2.加250ul预冷的solution I(RNA酶),涡旋振荡混匀(内置200ul枪头),使细胞尽量分散
3.加250ul solution II,盖紧管口,快速上下颠倒10次以上
4.加250ul solution III(2min内),盖紧管口,快速上下颠倒10次以上,离心13,000rpm 10min,取上清(不可吸到絮状沉淀)
5.上清置于对应编号的离心柱,下接集中管,离心10,000×g 1min(可重复一次,提高DNA量,即集中管液倒回离心柱)
6..弃集中管液,加HB 50ul离心10,000g 1min(可重复一次)
7.弃集中管液,加Wash Buffer 700ul(用前加无水乙醇)离心10,000g 1min(可重复一次)
8.弃集中管液,空柱离心13,000g 2min
9.加Elution Buffer 50ul ,下接标记好的Ep管,盖上离心柱的盖子 60℃, 温育10min,离心13,000g 2min
检测: 1%~1.2%的Agarose gel检测
2、组织/细胞RNA提取(Trizol法)
实验用品:
试剂:Trizol 试剂、无水乙醇、DEPC水、氯仿、异丙醇、液氮
物品:冰、灭菌玻璃试管、组织匀浆器、移液器与枪头、1.5ml Ep管、高速离心机、滤纸、Ep管架、timer、振荡器
注意事项:①RNA易被空气中的RNA酶降解,②提取过程中注意污染
实验步骤:
1.准备冰盒,取N支无菌玻璃试管,依次标记后插在冰盒中,每管加入1 ml Trizol 试剂,另取2支试管加入氯仿。
2.准备液氮罐,快速取出需要提取的组织冻存管放入其中。
3,取出N个Ep管,分别对应玻璃管双标记。
4.将组织匀浆器接好电源。
5.分别取各冻存管中的组织放入对应的无菌玻璃管中。
6.清洗组织匀浆器工作头。之后开始匀浆,一般匀3~5次,每次匀5~8秒,放于冰上约10 秒,再匀下一组织,所有组织匀完之后,洗净晾干,收好匀浆器。
7.最后一次组织匀完之后,计时5min ,静置匀浆的组织。
8.将玻璃试管中的组织倒入对应标记好的1.5ml Ep管中。
9.各管加入200 ul氯仿,盖好Ep管盖,两试管架紧扣Ep管,用力晃动约15s,室温孵育3min,然后4℃,12000×g 离心15min。
在此期间再标记一套新的Ep管。
10.缓慢吸取上层水相500 ul,转移至新标记的Ep管中,各加入200 ul氯仿,盖好Ep管盖,两试管架紧扣Ep管,用力晃动约15s,室温孵育3min,然后4℃,12000×g 离心15min。 再取一套灭菌的Ep管,与前面同样标记。
11.小心吸取上清液约500 ul(如果上清液不多,可以不吸够500 ul),放入对应标记的新管中。
12.各管加入500 ul异丙醇,振荡器混匀,室温孵育10 min,4℃,12000×g 离心10min。
13.吸去上清,各管加入75%乙醇in DEPC 1ml,振荡器混匀,4℃,17500×g 离心5min。
14.倒去上清,于滤纸上扣吸片刻,4℃,7500×g 离心1min,用移液枪吸去剩余上清,空气干燥约2min。
15.各管加入适量DEPC水,混匀溶解RNA,将各管置于冰上,以备检测。 注:提取细胞RNA的过程与提取组织的是一样的,只是不需要匀浆的过程
3、普通PCR扩增
体系:
原始浓度 终浓度 10*buffer 10× 1× Mg2+(buffer中有就不加) 25mM 1.5mM dNTP 2.5mM/each或2mM/each 200um/each template 2pg-1ug Primer 100um 1um enzyme 5U/ul 1-5U ddH2O 补足体系 扩增条件:变性—退火—延伸,根据需要设置时间,变性温度一般固定,退火温度根据Tm值确定,延伸温度根据酶的性质决定,延伸时间与片段大小以及酶的效率有关
4、琼脂糖凝胶电泳检测核酸
步骤:
1.根据需要的凝胶的浓度,计算所需琼脂糖的质量。
2.称量所需琼脂糖,加入对应体积的1×TAE。
3.微波炉加热溶解完全,即没有细小的颗粒产生为止。
4.冷却至60℃左右(不烫手),加入核酸染料,摇匀,倒入制胶槽中。
5.待胶凝固后即可点样。
6.将样品与6×loading(工作浓度1×)混合后加入点样孔中,调合适电压电泳。
7.电泳结束后放在紫外仪或凝胶成像系统中观察。
5、质粒/PCR产物的双酶切、连接
双酶切:
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