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第三章 生物信息的传递(上) ——从DNA到RNA RNA 除了某些RNA病毒之外,所有RNA分子都来自于DNA。基因组DNA通过一个被称为转录的过程把贮存在双链DNA分子中的遗传信息转换到与模板DNA链相互补的RNA单链上。 mRNA,编码了一个或多个蛋白质序列; tRNA,把mRNA上的遗传信息变为多肽中的氨基酸信息; rRNA,是合成蛋白质的工厂核糖体中的主要成份。 转录的直接产物被称为初始转录物 primary transcript 。它包含一条从启动子延伸到终止子含有原始的5`及3`端的RNA。 但初始转录物通常不稳定。在原核生物中,它或被迅速降解 对于mRNA ,或被剪接成为成熟产物 对于rRNA和tRNA 。而在真核生物中,它或被末端修饰 主要对于mRNA ,或被剪接成为成熟产物 对于所有RNA 。 关于基因表达的两个基本问题 RNA聚合酶如何找到DNA上的一个特异性启动子,而不和其它序列混淆? 调控蛋白是如何与RNA聚合酶相互作用。从而增强或抑制转录的起始、延伸,或终止的? 第一节 信使的发现 1955年Brachet用洋葱根尖和变形虫进行实验: 若加入RNA酶,则蛋白质合成就停止; 若再加入从酵母的RNA,又可合成蛋白质。 这表明什么? 1956年E. Volkin和 L.Astrachan,用同位素脉冲—追踪标记,表明T2噬菌体新合成的RNA的碱基比和它的DNA碱基比相似,而和细菌的碱基比不同。由于T2感染细菌时注入的是DNA,而在细胞里合成的是RNA, 此表明什么? 最令人信服的证据是Hall.B.D和Spiegeman,S的DNA-RNA的杂交实验。 将T2噬菌体感染E.coli后产生的RNA分离出来,分别与T2和E.coli的DNA进行分子杂交,结果这种RNA只能和T2的DNA形成“ 杂种”链,而不能和E.coli的DNA进行杂交。 Jacob和Monod预言: (1)这种“ 信使”应是一个多核苷酸; (2)其分子平均不小于5?105bp,足以携带一个基因的遗传信息; (3)它们至少是暂时连在核糖体上; (4)其碱基组成反映了DNA的序列; (5)它们能高速更新。 Jacob和Monod将它定名为:信使RNA(Messenger RNA)或mRNA。 第二节 RNA的酶促合成 一. RNA合成的基本特点 1960年Weiss,S,B等发现RNA聚合酶(RNA Pol)。 其特点是: (1)以核糖核苷三磷酸(rNTR)为底物; (2)以DNA为模板; (3)按5′-3′方向合成; (4)无需引物的存在能单独起始链的合成; (5)第一个引入的rNTP是以三磷酸形式存在; (6)在体内DNA双链中仅一条链作为模板; (7)RNA的序列和模板是互补的。 E.coli在 0?C时需13秒钟才能加上一个核苷酸,但在37?C每秒就可加上40个核苷酸;利用这个差别以14C来标记U,在0?C培养E.coli。 提取这种正在伸长的mRNA分子,发现14C标记首先出现在伸长的3′端,因此可以证明合成是延着5′-3′方向进行的。 RNA合成和DNA复制的区别 (1)转录时只有一条DNA链为模板,而复制时两条链都可作为模板; (2)DNA-RNA杂合双链不稳定,RNA合成后释放,而DNA复制叉形成后一直打开,新链和母成子链; (3)RNA合成不需引物,而DNA复制需引物; (4 转录的底物是rNTP,复制的底物是dNTP; (5)聚合酶系不同。 二 转录的基本过程 模板识别 Template recognition 起始 Initiation : 流产起始(abortive initiation) 在延伸 Elongation 阶段。 终止 Termination 第三节 细菌基因的转录 在细菌中一种RNA聚合酶负责所有mRNA、rRNA和tRNA的合成。一个E. coli细胞中约有7000 个RNA聚合酶分子。 它们中许多都参与转录;任意时刻大概有2000~5000 酶在合成RNA 此数字因细菌的生长状态而异 。 原核生物转录的起始延伸 (一)启动子(promoter)的结构和转录起始 1 结构典型,都含识别(R ,结合(B 和起始(I)位点; 2 序列保守; 3 位置和距离都比较恒定; 4 直接和多聚酶相结合; 5 常和操纵子相邻; 6 位于基因的5′端; 7 决定转录的启动和方向。 典型启动子的结构 -10序列是由Pribnow和Schaller(1975)发现,故也称为Pribnow框盒(Pribnow box)。 保守序列为T80A95T45A60A50T96 位于-10bp左右,A.T较丰富,易于解链。其功能是: 1 RNA pol紧密结合; 2 形
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