STS作图原理 合格的STS特点 序列已知 在染色体上独一无二 寻找STS办法 表达序列标签(expressed sequence tag ,EST)从cDNA克隆中找到小段顺序 SSLP 具有多态性并已在连锁分析中定位的SSLP具有特别的价值。 随机基因组测序 STS的物理定位 辐射杂种 克隆作图 辐射杂种 含有另一种生物染色体片段的啮齿类细胞 人体细胞射线照射,染色体随机断裂,剂量与片段大小成反比。将辐射后细胞与正常仓鼠细胞融合,片段将整合到鼠类细胞染色体中进行扩增。 利用胸苷激酶或次黄嘌呤磷酸转移酶的缺陷细胞,采用HAT培养基选择。获得TK和HPRT基因的可生长。 一般每个阳性杂种细胞保存DNA占人基因组15-30%,5-10Mb 仅含单个染色体的杂种群 含有单个染色体的啮齿类细胞与仓鼠细胞融合 利用短分散核因子(short interspersed nuclear element ,SINE)Alu为探针,挑选出含人基因组的杂种细胞。 Alu平均4KB就有一个 作图单位:厘镭(centriRay ,cR) DNA分子暴露在射线下两个分子标记之间发生1%断裂的频率。 克隆作图 来自于全基因组的克隆库 来自于单个染色体 人类基因组物理图 交变电场琼脂糖凝胶电泳 基于克隆的基因组作图 质料载体--λ克隆载体及λ与质料结合的粘粒-- 拟南芥,1.2×108,需要2500
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