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- 2017-03-09 发布于贵州
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PRV、PCV2、PPV多重PCR试剂盒的研制
PRV、PCV-2、PPV多重PCR试剂盒的研制
余波 谭诗文?1 冉懋韬1 杨丽娟1徐景峨1 史开志1
(贵州省畜牧兽医研究所,贵州 贵阳550005)
摘要:根据GenBank中的猪伪狂犬病病毒 PRV gE、猪圆环病毒2型 PCV-2 ORF2、猪细小病毒 PPV VP2基因序列,设计了3对引物,研制了检测PRV、PCV-2和PPV的多重PCR试剂盒。该试剂盒扩增的阳性条带分别为bp、bp、bp。敏感性、特异性结果显示,该试剂盒对3种病毒的最低核酸检测量分别为PRV 4.2pg/L、PCV-2 3.7pg/L、PPV 0.ng/L,而猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征(PRRSV)、大肠杆菌、猪支原体的扩增结果均为阴性。对125份自然感染病猪样品的检测结果表明,该试剂盒检测结果与单一PCR检测结果完全符合。结果表明该多重PCR试剂盒具有很好的特异性和敏感性,可用于临床PRV、PCV-2和PPV的检测。
PRV)、猪圆环病毒(PCV-2)、猪细小病毒(PPV)造成的猪繁殖障碍性疫病越发严重,常常出现混合感染,给养猪场造成了巨大的经济损失[1-3]。目前,主要的检测方法有病毒分离鉴定、琼脂扩散试验、微量血清中和试验、ELISA、PCR方法。然而常规的诊断方法很难将此症状相似的疾病同时加以区别,而且常规的病原学和血清学检测方法,又存在操作繁杂、费时费力、敏感性低等不足。多重PCR(multiplex PCR,mPCR)诊断方法可一份样品中同时检测出多种病原体,且特异性和敏感性高、检测时间短、检测成本低,适合大量临床样品(特别是混合感染样品)中病原体的快速诊断。本研究根据GenBank中的猪伪狂犬病病毒 PRV gE、猪圆环病毒2型 PCV-2 ORF2、猪细小病毒 PPV VP2基因序列,设计了3对引物,研制了检测猪PRV、PCV-2和PPV的多重PCR试剂盒RV、PCV-2和PPVPRV、PCV-2、CFSV石门系株、PRRSV美洲株株、大肠杆菌、支原体为本研究室保存。
1.2 主要试剂
Goldview、Tris、EDTA、Taq DNA Polymerase(5U/μL)及相应10Taq Buffer、dNTP等购自;GenBank中登录的 PRV gE、PCV-2 ORF2和PPV VP2基因组序列,应用DNAStar软件,设计了3对引物,用于扩增PRV、PCV-2、PPV目的基因片段,引物的序列。PRV上游引物:5’ –CCCACGCACGAGGACTAC–3’,PRV下游引物:5’ –GGGCGGGACATCAACAGG–3’ ,目的片段大小300bp。PCV-2上游引物:5’–GGATTGTATGGCGGGAGG–3’PCV-2下游引物:5’ –AGGAGGCGTTACCGAAGGAG–3’,目的片段大小420bp,PPV上游引物:
5’–GGGAGGGCTTGGTTAGAATC–3’,PPV下游引物:5’ –TTGTTTGCCA
TGAGTGAGTT–3’, 目的片段大小680bp。
1.4 病毒核酸的抽提
取待检样品肝、脾、肺、淋巴结、扁桃体、脑等组织样品共约0.2 g,加入500μL PBS缓冲液,待检样品研磨后-20℃反复冻融3次12000 r/min离心取上清用于病毒核酸的提取。病毒DNA/RNA的提取参照TIANamp病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒说明书进行,将提取的DNA和RNA于-70℃保存。支原体、大肠杆菌DNA用煮沸法提取DNA。
1.5 单一病毒PCR扩增
单一病毒的PCR反应在25 μL体系中进行,Primer1/2各μL、10×Taq Buffer 5μL、dNTP mixture μL、Taq DNA polymeraseμL、ddH2O 加至 μL,94℃ 5 min;94℃ 30s,55℃1 min,72℃ 1 min,30个循环;最后72℃延伸10 min。取5μLPCR扩增产物于10g/L琼脂糖凝胶中进行电泳鉴定。
1.6 多重PCR反应条件的优化
对多重PCR反应条件,包括退火温度(54~60℃),引物浓度(5~20 μmol/L),Taq DNA polymerase浓度(0.5~3.5 U)进行优化,以确定最佳反应条件,同时以双蒸水作为空白对照。多重PCR反应在50μL反应体系中进行,10×Taq Buffer 10μL,dNTP mixture 8μL;Taq DNA polymerase 1μL,用双蒸水补足至50μL。反应条件为:94℃ 5 min;94℃ 1 min,54~60℃ 1 min,72℃ 1min,30个循环;最后72℃延伸10min。取5μL PCR扩增产物于10 g/L琼脂糖凝胶中进行电泳鉴定。
1.7 敏感性试验
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