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什么是二核苷酸CpG? 由胞嘧啶(C)和鸟嘌呤(G)组成的一个2个核苷酸的链,当中的p是C和G之间的磷酸CpG岛就是由胞嘧啶(C)和鸟嘧啶(G)组成的串联重复序列 哺乳动物细胞中已知有活性的 DNMT 有 3 种 ,它们是 DNMT1 、DNMT3a 、DNMT3b 。 DNMT1 的主要功能是作为 DNA 复制复合物(DNA synthesome) 中的组分 ,催化子链 DNA 半甲基化位点甲基化 ,维持复制过程中甲基化位点的遗传稳定性; DNMT3a 和 DNMT3b 主要催化从头甲基化 ,以非甲基化的 DNA 为模板 ,催化新的甲基化位点形成 ,在胚胎发育中起重要作用。 改变已有的甲基化必须要有一种机制可移除已存在的甲基化 第一种:被动去甲基化,因为DNMT1不能维持已经存在的甲基化而诱发 第二种:在甲基化酶的作用下主动地去甲基化。 在近期的《细胞》(Cell)杂志上,Heintz、Kriaucionis和同事们报告称,5hmC标记对于基因表达的影响与5mC相反,并在小鼠的健康脑细胞中鉴别了5hmC信号检测及广泛解读的机制。众所周知,广泛的肿瘤细胞中都存在5hmC分布改变,这些研究发现可能对于癌症研究具有重要的价值。 人体的几乎每个细胞都携带着一份完整的人类基因组。那么人类眼中的感光细胞为何会与心脏或脾脏的细胞如此的不同? 答案当然是因为每种细胞类型只选择性表达了一套独特的基因,而主动沉默了与它的功能无关的基因。 科学家们很早以前就知道,那样的基因沉默是借助于对DNA碱基胞嘧啶的化学修饰,生成称作5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine ,5mC)的一种“表观遗传”标记而实现。 这一标记适当分布不仅对于胚胎发育,且对于许多正常的生物学过程均至关重要。相反,它的错误分布会促成广泛的癌症进化。 5-羟甲基胞嘧啶 5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine)的分子式是C5H7N3O2,被称为“第六种碱基”。 1972年Penn等在哺乳动物大鼠、小鼠?以及卵生动物牛蛙脑组织提取的DNA中也发现了羟基化修饰的胞嘧啶, 约占DNA总胞嘧啶的15% 左右,但此后的研究未能重复这一结果。 2009 年,Tahiliani和Kriaucionis的两个研究团队在同一期Science中分别报道了5hmC 在人、小鼠大脑及胚胎干细胞中有着丰富表达, 羟甲基化的概念才又一次进入人们的视野并得到了重视。目前5hmC是继5mC被称为“第5 个碱基”之后的“第6 个碱基”。 第二节:核小体和组蛋白修饰 核小体:核小体是染色体的基本结构单位,由DNA和组蛋白(histone)构成。由几种组蛋白: 每一种组蛋白各二个分子,形成一个组蛋白八聚体,约146bp的DNA分子盘绕在组蛋白八聚体构成的核心结构外面两周,形成了一个核小体。 组蛋白修饰机制 组蛋白修饰:是指组蛋白在相关酶作用下发生甲基化、乙酰化、磷酸化、腺苷酸化、泛素化、ADP核糖基化等修饰的过程。 第三节:组蛋白甲基化的研究进展 组蛋白于1834年由德国科学家A.科塞尔发现。早在1888年德国化学家科塞(A.Kossel)已从细胞核中分离出组蛋白,并认识到它们作为碱性物质应在核中与核酸结合,但直到1974年才了解组蛋白的确切作用。一些实验室随后证明组蛋白以独特的方式构成核小体的组分。 1 组蛋白甲基转移酶 (1)组蛋 白 做 为 甲 基 转 移 酶 底 物 的 最 早 记 载 是 在 1964年 。早期通过对大量蛋白质序列的研究 ,利用生化标记追踪大量组蛋白序列发现 , H32 K4 、 H32 K9 、 H32 K36 、 H42 K20 都是易发生甲基化的位点 ,除此之外 ,实验发现精氨酸也可以被甲基转移酶作用 。一般认为 ,组蛋白只有赖氨酸和精氨酸是甲基转移酶的作用位点 。 (2)催化精氨酸 (Arg) 甲基化的酶被通称为蛋白质精氨酸甲基转移酶 (protein arginine methyltransferase , PRM T) 家族 ,这类酶主要催化甲基从 S2酰苷甲硫氨酸向精氨酸中胍基氮的转移 。 H32 K9 甲基化与异染色质的形成小鼠中的 suv39h1 和 suv39h2 两种基因编码的甲基转移酶对于异染色质的形成很重要 ,若将这两个基因同时突变(称为 Suv39h2 null) ,细胞中 H32 K9 的甲基化会减少一半 ,这样出生的小鼠孟德尔性状低 、生长缓慢 、有丝分裂中染色体的分离有缺陷 ;而在野生型细胞中 ,Suv39h1 与 HP1 (一种异染色质蛋白 ,参与染色体高级结构的形成) 共同定位在间期核的异染色质区 ,这样的小鼠很正常 。 H32 K9 甲基化对常染色体中基因表达调控的影响实
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