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环糊精与酶的活性位点之间的底物桥接所触发的一种独特的抑制模式 摘要： 背景：甲硫氨酰-7-氨基-4-甲基香豆素（MetAMC）作为甲硫氨酸氨基肽酶（MetAP）的催化反应的酶作用物，并通常用于筛选化合物以确定潜在的抗生素剂。为了筛选酶的抑制剂，我们观察到用于的溶解疏水性抑制剂——2—羟丙基-β-环糊精 (HP-β-CD)，抑制了酶的催化活性，这种抑制不完全是由于HP-β-CD的底物吸收作用。 方法：通过进行稳态动力学，配体 - 受体结合，X射线晶体学和分子模拟研究方法，对HP-β-CD对MetAP的介质抑制机理进行探讨。 结果：β环糊精酶作用物（β-CD-MetAMC）复合物的X射线晶体学数据表明虽然酶作用物的7-氨基-4-甲基香豆素（AMC）部分是在环糊精（CD）腔内，但是蛋氨酸部分向外突出。HP-β-CD-MetAMC抑制MetAP的稳态动力学数据符合一个模型机制，该模型机制的底物在HP-β-CD和酶的活性位点口袋之间桥接，形成HP-β-CD-MetAMC-MetAP具有催化性质的无活性三元复合物。分子模型表明HP-β-CD结合MetAMC底物的易断裂键无法到达酶的催化中心的附近，并且因此底物无法裂解。 结论：本文中所呈现的数据表明，这种酶和HP-β-CD的空腔之间的底物桥接是通过其表面的相互作用实现，并且所生成的复合物抑制了酶的活性。 一般意义：由于