蛋白质化学2.ppt

超二级结构类型 ? ? ??? ??? ? ? ? 丙酮酸激酶结构域4 羧肽酶 腺苷酸激酶 (a) (b) 丙糖磷酸异构酶 乳酸脱氢酶结构域1 黄素蛋白 平行?-折叠的结构比较（a） ?-园桶形排布，（b）马蹄形排布 毛发横切面和毛发?-角蛋白的结构 原纤维 细胞 ?-螺旋 角质层（鳞状细胞） 微纤维 微纤维 大纤维 A.堆积的?-折叠片的三维结构 丝心蛋白(fibroin)结构 B.交替层中的Ala(或Ser)残基和Gly残基侧链(H原子)的连锁 原胶原蛋白分子中的 单链（左手螺旋） 一股原胶原蛋白分子 胶原纤维 原胶原蛋白的头 胶原纤维(collagen fibril)中原胶原蛋白分子的排列 六、 球状蛋白质与三级结构 三级结构（ tertiary structure ）是指球状蛋白质的多肽键在二级结构的基础上，通过侧链基团的相互作用进一步卷曲折叠，借助次级键维系使α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲等二级结构相互配置而形成特定的构象。三级结构的形成使肽链中所有的原子都达到空间上的重新排布。 α-螺旋 β-折叠 β-转角 无规则卷曲 空穴 特征： ?含多种二级结构单元； ?有明显的折叠层次； ?是紧密的球状或椭球状实体； ?分子表面有一空穴(活性部位)； ?疏水侧链埋藏在分子内部， 亲水侧链暴露在分子表面。 实例：肌红蛋白，核糖核酸酶 抹香鲸肌红蛋白（Myoglobin）的三级结构 核糖核酸酶三级结构示意图 N His12 C His119 Lys41 七、亚基缔合与四级结构 四级结构(quarternary structure)指由相同或不同的称作亚基（subunit）的亚单位按照一定排布方式缔合而成的蛋白质结构，维持四级结构稳定的作用力是疏水键、离子键、氢键、范得华力。亚基本身都具有球状三级结构，一般只包含一条多肽链，也有的由二条或二条以上由二硫键连接的肽链组成。对称性是四级结构蛋白质最重要的性质之一。 四级缔合在结构和功能上有很多优越性：增强结构稳定性；提高遗传经济性和效率；使催化剂基团汇集在一起；具有协同性和别构效应。 实例：血红蛋白 烟草花叶病毒的外壳蛋白四级结构 人免疫缺陷病毒（HIV-1）结构的面图剖 四级结构中相同单体亚基的几种可能对称排列 假设的单体 C2对称 C3对称 C4对称 D2对称 D3对称 四级结构中相同单体亚基的几种可能对称排列（续前） T对称 八面体对称 螺旋对称 二十面体对称 血红蛋白四级结构 烟草花叶病毒外壳蛋白四级结构的自我组装 人免疫缺陷病毒（HIV-1）结构的面图剖 单链RNA 寄主蛋白质 被膜（脂双层） 反转录酶 gp120 gp41 第五节 蛋白质的分子结构与功能 一、同源细胞色素c的种属差异与分子进化 二、一级结构的局部断裂与蛋白质的激活 二．肌红蛋白和血红蛋白的结构与功能 三．免疫球蛋白的结构与功能 蛋白质复杂的组成和结构是其多种多样生物学功能的基础；而蛋白质独特的性质和功能则是其结构的反映。蛋白质一级结构包含了其分子的所有信息，并决定其高级结构，高级结构和其功能密切相关。 一、细胞色素c的分子进化 1、细胞色素c的氨基酸序列的种属差异和分子进化 2、细胞色素c的三级结构的活性部位的保守性 生物 与人不同的AA数目 黑猩猩 0 恒河猴 1 兔 9 袋鼠 10 牛、猪、羊、狗 11 马 12 鸡、火鸡 13 响尾蛇 14 海龟 15 金枪鱼 21 角饺 23 小蝇 25 蛾