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- 2016-10-20 发布于湖北
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ATAD2B保守核蛋白的生物信息分析
作者:许媛媛 联系方式:876346605@
单位:德州学院生命科学学院生物科学专业
摘要:为了研究该基因的特性,本研究运用生物信息学的方法对ATAD2B(是在神经元分化和肿瘤发生表达了进化上很保守核蛋白) F1SHA1基因及其氨基酸序列的同源性、理化性质、保守结构域、亚细胞定位、信号肽、跨膜结构域、亲水性/疏水性、二级结构、功能预测以及磷酸化位点等进行预测分析。结果表明在在神经元分化和肿瘤发生表达保守核蛋白,F1SHA1基因共编码1465个氨基酸。相对分子量为165453.8 Da,带负电,偏酸性。F1SHA1在280 nm 的波长下的消光系数为 85980M-1·cm-1 , 其半衰期为 30小时,其结构不稳定。根据信号肽假说,可以推测出此蛋白不是分泌蛋白。F1SHA1 只含有 1 个属于 GNS1/SUR4家族的保守结构域,运用 PSORT 工具预测F1SHA1的亚细胞定位,该基因可能位于细胞骨架、细胞质、 核上。该基因蛋白的最可能的功能是运输和结合。它的蛋白质的二级结构是指多肽链主链骨架盘绕折叠而形成的构象, 借氢键维系。
关键词:多克隆抗体ATAD2B:F1SHA1;信号肽;生物信息学
1、生物信息学分析
运用 NCBI 和 ProtParam 进行核酸和氨基酸序列组成和理化性质
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