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生物信息学 主讲: 叶建平 电话: E-mail: 第一节 生物分子信息与生物信息学 第二节 生物信息学的研究目标和任务 第三节 生物信息学的研究意义 第四节 生物信息学的发展历史 第五节 人类基因组计划和基因组信息学 生物分子信息的特征 生物分子信息数据量大 生物分子信息复杂 生物分子信息之间存在着密切的联系 Bioinformatics 第二节、生物信息学的研究目标和任务 收集和管理生物分子数据 数据分析和挖掘 开发分析工具和实用软件 生物分子序列比较工具 基因识别工具 生物分子结构预测工具 基因表达数据分析工具 第三节、生物信息学研究意义 认识生物本质 了解生物分子信息的组织和结构，破译基因组信息，阐明生物信息之间的关系。 改变生物学的研究方式 改变传统研究方式，引进现代信息学方法 在医学上的重要意义 为疾病的诊断和治疗提供依据 为设计新药提供依据 人人可以从事生物信息学研究； 生物信息学是门新技术。 第四节 生物信息学的发展历史 20世纪50年代，生物信息学开始孕育 20世纪60年代，生物分子信息在概念上将计算 生物学和计算机科学联系起来 20世纪70年代，生物信息学的真正开端 20世纪70年代到80年代初期，出现了一系列著 名的序列比较方法和生物信息分析方法 20世纪80年代以后，出现一批生物信息服务机 构和生物信息数据库 20世纪90年代后，HGP促进生物信息学的迅速 发展 生物信息学发展过程中的里程碑性事件 生物信息学相关杂志 《 Bioinformatics》期刊，它的前身是《Computer Applications in the Bioscience》(CABIOS)，1998年更名《Bioinformatics》。该杂志主要发表计算分子生物学、生物数据库和基因组生物信息学方面的文章。 另外带有生物信息学字样的杂志还有《Applied Bioinformatics》、《Briefings in Bioinformatics》、《Journal of bioinformatics and computational biology》、《Genomics, proteomics bioinformatics》、《Proceedings / IEEE Computer Society Bioinformatics Conference》以及网上生物信息学杂志《BMC Bioinformatics》等。 其它与生物信息学相关的出版物还很多，如《Nucleic Acids Research》、《Genome Research》、《Genomics》、《J. Mol. Biol.》、《BioTechniques》、《BioTechnology Software》等。 第五节 人类基因组计划和基因组信息学 人类基因组计划 HGP(Human Genome Projects) 1、HGP简介 2、HGP的主要任务 3、HGP对人类的重要意义 4、我国对人类基因组计划的贡献 5、HGP进展 6、HGP对生物信息学提出挑战 7、基因组相关的伦理学问题 1、HGP简介 人类基因组计划是由美国科学家于1985年率先提出，于1990年正式启动的。美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共同参与了这一价值达30亿美元的人类基因组计划。这一计划旨在为30多亿个碱基对构成的人类基因组精确测序，发现所有人类基因并搞清其在染色体上的位置，破译人类全部遗传信息 。 曼哈顿计划 阿波罗计划 人类染色体 科学家的胆略 诺贝尔奖获得者Renato Dulbecco于1986年发表短文??《肿瘤研究的转折点：人类基因组测序》（Science, 231: 1055－1056）。 文中指出：如果我们想更多地了解肿瘤，我们从现在起必须关注细胞的基因组。…… 从哪个物种着手努力？如果我们想理解人类肿瘤，那就应从人类开始。 HGP的诞生 1984年12月Utah州的Alta,White R受美国能源部的委托，主持召开了一个小型会议，讨论DNA重组技术的发展及测定人类整个基因组的DNA序列的意义。 1985年6月，在美国加州举行了一次会议，美国能源部提出了“人类基因组计划”的初步草案。 1986年6月，在新墨西哥州讨论了这一计划的可行性。随后美国能源部宣布实施这一草案。 1987年初，美国能源部与国家医学研究院（NIH）为“人类基因组计划”下拨了启动经费约550万美元，1987年总额近1.66亿美元。同时，美国开始筹建人类基因组计划实验室。　　　　 198