生物信息学第一章生物信息学教案分析.pptVIP

大规模测序基本策略 逐个克隆法：小片段针对图谱的！！ 全基因组鸟枪法：大片段-测序-组装（美国Celera公司） Contig：重叠群，基因组测序中将许多序列片段经过比对找到重叠区,从而连接成的长片段。 A B C D E F G H I J K L CONTIG GAP 基因组比较 蛋白质结构 蛋白质序列 蛋白质功能关系 核苷酸序列 高通量测序技术 注释、解析 预测 验证 基于生物信息学的新药设计 基因组 数据库 蛋白质 序列 数据库 蛋白质 结构 数据库 DDBJ EMBL GenBank SWISS-PROT PDB PIR （1）生物分子数据的收集与管理 生物信息学的主要研究内容 EMBL欧洲分子生物学实验室，于1974年由欧洲14个国家加上亚洲的以色列共同发起建立，包括一个位于德国Heidelberg的核心实验室，三个位于德国Hamburg，法国Grenoble及英国Hinxton的研究分部。 GenBank是美国国家生物技术信息中心建立的DNA序列数据库，从公共资源中获取序列数据，主要是科研人员直接提供或来源于大规模基因组测序计划。 DDBJ日本DNA数据库，于1984年建立，是世界三大DNA 数据库之一，与NCBI的GenBank，EBI的EMBL数据库共同组成国际DNA数据库。 SWISS-PROT是经过注释的蛋白质序列数据库，由欧洲生物信息学研究所