小群体基因的随机漂变模拟-课程报告.docVIP

小群体基因的随机漂变模拟 为了研究群体遗传组成的变化，必须弄清楚某一代基因频率和基因型频率在下一代的变化情况。对于无限大的群体，这种能够连续随机交配的群体，如果自然选择，突变，迁移，随机变化等因素不发生作用，则每代的基因频率和基因型频率不变，合子数组就等于配子数组的二次方。对于一对等位基因A,a在群体中的频率是平衡的，不会随着世代的变化而变化。但是在实际情况中，这种平衡是收到很多因素的影响的。我所了解到的有以下五个方面： 1）随机交配的偏移 2）基因频率的随机漂移 3）突变 4）群体间的迁徙 5）自然选择 这里我主要想分析的是在小群体中，随机漂变对基因频率的影响。因为当群体不大时，某一代基因库中抽样形成下一代个体的配子时所发生的误差，严重影响地影响群体的基因频率。 一．理想小群体的繁育过程: 1．假设：有一对等为基因：A,a。 现观测200个相互独立的小群体，它们之间不发生交配，并且群体内部随机交配。 有效群体大小N=16 。0世代时任一子群的内部基因频率都为P(A)=p0=0.5 P(a)=q0=0.5 。 这种假设任一子群体内P(A)=p0，P(a)=q0。则在这个繁育群体产生的配子库中，随机取出2N个配子，其中A配子恰好出现r次的概率，服从二项分布: E（Pt）=P0 V（Pt）=p0×q0×[1-（1-1/2N）t] 2．计算机拟合理想小群体的繁育过程 繁育群体