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蛋白电泳小tips
蛋白电泳小tips
蛋白质的聚丙烯酰胺凝胶电泳
一.试剂制备:
1.分离胶缓冲液(pH8.9):36.6gTris,48ml1mol/l的HCl,或先加水至80ml,用浓HCl调pH,再定容至100ml.
2.浓缩胶缓冲液(pH6.7):5.98gTris,48ml1mol/l的HCl, 或先加水至80ml,用浓HCl调pH,再定容至100ml.
3.30%丙烯酰胺(pH≤7.0):29g丙烯酰胺和1g甲叉双丙烯酰胺,溶于60ml水中,加热至37ordm;C溶解,补水至100ml,用棕色瓶贮存于室温,几个月后重新配置。
4.10%过硫酸铵(W/V):1g溶于10ml水中,4ordm;C保存数周,尽量现用现配。
5.四甲基乙二胺(TEMED)
6.10%SDS。将10gSDS溶于80ml重蒸水中并轻缓搅拌(室温低时需水浴加热溶解),再定容至100ml,室温存放。
7.样品缓冲液:5ml1mol/l的Tris-HCl(pH6.7),2.5gSDS,1ml巯基乙醇,0.05g溴酚兰,10g蔗糖,加水定容至100ml。
8.考马斯亮蓝染色液:0.25g考马斯亮蓝R-250用少量甲醇溶解后,用甲醇(40ml)-乙酸(10ml)水溶液稀释至100ml。
9.脱色液:90ml甲醇:水(1:1)和10ml冰醋酸配成100ml脱色液
10.Tris-甘氨酸电泳缓冲液(pH8.3):在900ml去离子水中溶解15.1gTris碱,94g甘氨酸,加入50ml10%(W/V)的电泳级SDS贮液,用去离子水补至1000ml量则成5×贮液。
二.电泳
1.用1%琼脂将长玻璃板下端封住,冷凝30分,灌12%分离胶(4.9ml蒸馏水,6.0ml30%丙烯酰胺,3.8ml1.5mol/lTris-HCl,150μl10%SDS, 150μl 10%过硫酸铵, 6μl TEMED),灌到至短玻璃板4cm,用水封住,冷凝30分后将水倒出,吸干,灌满5%浓缩胶(5.5ml蒸馏水,1.3ml30%丙烯酰胺,1.0ml1.5mol/lTris-HCl,80μl10%SDS, 80μl 10%过硫酸铵, 8μl TEMED)后立即插入梳子,冷凝30分后取出梳子,将1×电泳缓冲液倒入电泳槽,并淹没短玻璃板
2.取30μl蛋白提取液与30μl样品缓冲液混合,于100℃水浴加热3min使蛋白变性,用微量进样器以50μl的量注入点样孔,不加样槽注入样品缓冲液。
3.以浓缩胶中100V,分离胶中180V电压进行电泳,至距底线1cm时关闭电源
4.将电泳后的凝胶取出,置于培养皿中,用蒸馏水冲去残留缓冲液,加入染色液将凝胶完全浸泡其中,放入微波炉内,高火档照射20秒,停留1min,再照射10秒,反复几次至凝胶上色后倒出染色液,用蒸馏水冲去残留染色液,加入脱色液,高火档照射20秒,倒出脱色液,再加入新鲜脱色液照射20秒,重复5-6次,直至背景清晰透明,于凝胶分析仪上成像分析。
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实验室日常小技巧集锦:
平时在实验室最常听到的一句话就是“今天某某试验没做好是为什么?今天某某试验没出结果是什么原因?今天某某试验为什么会是这样的呢?” 等等。然后仔细一查找原因,往往是由于操作上面的不认真,或是一些小小的细节没有注意到。以下是集各路朋友的一些经验,与大家分享:
1. 跑page胶的时候,小电压跑会避免高电压产生的热量尔导致的胶层变形。低电压泳道会比大电压泳道跑的直一些,且分离效果更高,有利于分子量相差不大的蛋白分离。
2. 提取质粒的时候,最后一步的酒精挥发很关键,基本上是其后续的酶切反应的决定性因素。所以这一步尽量挥发长一点时间,最好是空调吹热风,或是37度温箱放长一点的时间,我试过室温过夜,酶切很好。
3. 做WESTERN BLOT 的时候,大家往往会摸索一抗、二抗的浓度,封闭时间,曝光时间等等,而每次变换其中的一个条件就需要从新跑胶、转膜,甚至重新提蛋白,这样会浪费大量的时间。其实完全没有必要这样。一次转膜后,将PVDF膜晾干,裁减成小块,保存起来,用的时候取出一块,没有任何影响。这对于摸索条件的战友来说,节约了大量的时间。
4. 有关缓冲液和培养基配置
1)将缓冲液配方中的成分分别以10-100倍配成母液储存,需要的时候只需将相应的母液混合,补加水稀释即可
2)配培养基时通常会忘记各成分的量,如配LB时的三个成分不记得到底哪个是5g,哪个要10个,因此可以在常用的试剂瓶的标签上注明所需的量,如配LB时,在NaCl瓶外注明10g/L, yeast 5 g/L, tryton 10 g/L等,很方便,不需要每次配之前临时翻书
5. 有关PCR主反应液配置:
在做克隆鉴定的时
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