蛋白质工程2.docxVIP

蛋白质工程 一、名词解释： 1.蛋白质工程:是研究蛋白质结构和定点改造蛋白质结构的一门学科。它利用基因工程手段，通过有控制的基因修饰和基因合成，对现有蛋白质进行定向改造，以期获得性能更加优良、更符合人类社会需要的蛋白质分子。 2. 抗体:指机体的免疫系统在抗原刺激下产生的可与相应抗原发生特异性结合的免疫球蛋白。 3. 人-鼠嵌合抗体：用鼠可变区和人恒定区融合形成的抗体。 4.人源化抗体：将鼠杂交瘤抗体的超变区嫁接到人抗体上形成的抗体。 5. 一级结构：是多肽链中氨基酸残基从N-末端到C-末端的排列顺序及二硫键的位置。 6.二级结构：是指多肽链主链借助氢键排列成特有的规则的重复构象。 7.超二级结构（结构模体）：一级顺序上相邻的二级结构在三维折叠中，彼此靠近、按特定的几何排布形成排列规则的、在空间结构上能够辨认的、可以同一结构模式出现在不同蛋白质中的二级结构组合体，称为结构模体。 8.发夹式β模体（或ββ组合单位）：两段相邻的反平行β链被一环链连接在一起构成的组合单位，其形貌与发夹相似，称为发夹式β模体。 9.希腊钥匙模体：四段紧邻的反平行β链以特定的方式来回往复组合，其形貌类似于古希腊钥匙上特有的回形装饰纹，故称为希腊钥匙型模体。 10.β-α-β模体:是序列上连续、相邻的两股平行β链和一段α螺旋连接而形成的组合。 11.结构域：二级结构和结构模体以特定的方式组织连接，在蛋白质分子中形成两个或多个在空间上可以明显区分的三级折叠实体，称为结构域。 12.三级结构：在二级结构、结构模体的基础上，进一步盘曲、折叠形成的，包括主链、侧链在内的所有原子和基团的空间排布。 13.四级结构：是指在多条肽链组成的一个蛋白质分子中，各亚单位在寡聚蛋白质中的空间排布及亚单位间的相互作用。 14.优势构象：任何氨基酸侧链中的组成基团都可以绕着其间的C-C单键旋转，从而产生各种不同的构象。AA分子的各种构象异构体并不是平均分布的, 总是以其最稳定的构象为主要的存在形式即为优势构象。 15.交错构象：是能量上最有利的排布，在这种构象中，一个碳原子的取代基正好处于另一个碳原子的两个取代基之间。 16.旋转异构体：大多数氨基酸残基的侧链都有一种或少数几种交错构象作为优势构象最经常出现在天然蛋白质中，称旋转异构体。 17.肽键：由一个氨基酸的α-COOH 与另一个氨基酸的α-NH2脱水缩合形成的共价键（或酰胺键）。肽键具有局部双键性质，其键长比一般的C-N单键短，因此肽键不能旋转。肽键有反式(trans)和顺式(cis)两种构型。 18.肽：通过肽键将氨基酸连接在一起而形成的链状化合物。 19.构型：是一个分子中原子的特定空间排布。当一种构型改变为另一种构型时必须有共价键的断裂和重新形成。 20.构象：是组成分子的原子或基团绕单键旋转而形成的不同空间排布。 21.肽单位：由于肽键具有部分双键性质，肽键连接的基团处于同一平面，具有确定的键长和键角，是多肽链中的刚性结构，称为肽单位（或肽平面）。 22.多肽主链：有序连接的肽单位就是多肽链的主链。 23.扭角：由4个原子(或基团)组成的系统投影在与B-C键正交的平面上，A-B键投影与C-D键投影之间的夹角称为扭角。（这个角度也可视为A-B-C决定的平面与B-C-D决定的平面间的夹角，故也称为双面角） 24.拉氏构象图：Ramachandran根据蛋白质中 非键合原子间的最小接触距离,确定了哪些成对二面角（φ，ψ）所规定的两个相邻肽单位的构象是允许的,哪些是不允许的,并且以φ为横坐标,以ψ为纵坐标,在坐标图上标出,该坐标图称拉氏构象图。 25.偶极子：大小相等符号相反的两个电荷组成的体系。 26.偶极矩（μ）：正、负电荷中心间的距离（r）和电荷中心所带电量(q)的乘积。μ=r×q。它是一个矢量，方向规定为从正电中心指向负电中心。 27.疏水内核：是指蛋白质分子内部的疏水侧链紧密堆积而构成的疏水区域。 28.疏水作用：是指蛋白质疏水基团彼此靠近、聚集，以避开水的现象。 29.β层: 两条或多条伸展的β链侧向聚集，通过相邻肽链主链上的N-H与C=O之间有规则的氢键连接形成的锯齿状片层结构。 30.混合型β层: 即一部分以平行方式排布，而另一部分以反平行方式排布。 31.环肽链：在蛋白质的三维结构中，连接相对刚性的α螺旋和β层组合的环状肽链，称环肽链(loop)。环肽链常具有相当不同的长度和形貌（即构象的灵恬性），并具有较大的构象柔性。是蛋白质结构的另一类基本组件。回折结构的基本特征是使其所连接的肽链发生180°的急转弯。 32.β转折：是由4个氨基酸残基[i～(i+3)]顺序连接的，使肽链弯折180°的特殊构象。 33.γ转折：由三个氨基酸残基构成的，使肽链弯折180°的构象。 34.β