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基因表达的时间特异性 基因表达的空间特异性 存在于基因内外，与基因表达调控相关、能够被基因调控蛋白特异性识别和结合的特定的DNA序列称为顺式作用元件（cis-acting elements）。主要包括启动子 (pomoter)、增强子 (enhancer)和沉默子 (silencer) 等。 转录激活可能作用机制 介导转录相关蛋白的化学修饰和构象改变 改变启动子周围的染色质的结构 招募RNA聚合酶，促其快速准确定位 螺旋-回折-螺旋 （helix-turn-helix，HTH） Helix-turn-helix motifs How does the lac repressor bind DNA? Zinc-Finger Motifs Leucine zippers (bZip) 三、真核基因表达调控——正性调节占主导 采用负性调节机制不经济 保证基因表达调节的特异性 保证基因表达调节的精确性 常染色质（euchromatin） 异染色质（heterochromatin） 组蛋白密码（histone code） 染色质重塑（chromatin remodeling） 异染色质（heterochromatin） 结构高度致密，处于凝聚状态的染色质，对DNase I不敏感。基因表达处于阻遏状态。 2、组蛋白共价修饰 组蛋白修饰包括组蛋白的乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化和多聚ADP-核糖基化。这些多样化的修饰及其时空的组合可以使组蛋白与DNA的亲和力改变，改变染色质的结构，从而影响生物学功能。因此被称为组蛋白密码（histone code）。 转录前起始复合物 二、转录后调控 修饰 剪接 编辑 定向转运 降解 DNA DNA recognition helix turn Second alpha helix 同源异型域 （homeodomain，HD） 锌指结构（Zinc finger） C2H2型锌指 反向平行β片层 DNA大沟 α螺旋 Zn2＋ C C H H Zn C C H H Zn C C H H Zn Several subtypes (Cys4, Cys2-His2 …) Example: Cys2 His2 type Zinc does not interact with DNA Usually multiple zinc-fingers in a row At least some also bind RNA Consensus sequence: [Y,F]-X-C-X2-4-C-XXX-F-XXXXX-L-XX-H-X3-5-H 亮氨酸拉链（leucine zipper） Basic region of the protein binds to DNA Mainly act as dimers or other sometimes as other multimers Special alpha-helices allow formation of coiled-coil structures. Hydrophobic residues (Leu) align on one side of the helix Example: Jun and Fos 7 7 7 7 碱性螺旋-环-螺旋（basic helix-loop-helix，bHLH） bHLH双体 DNA大沟 螺旋 螺旋 环 第 二 节 Chromosomal Regulation of Eukaryotic Gene Expression 真核基因表达的染色质水平调控 基本概念 结构松弛，分散分布在核内的染色质，对DNase I敏感，DNA可降解为约200 bp 或其倍数的片断；基因表达处于活性状态，故亦称为活性染色质。 使用DNase I处理活性染色质时，常会出现一些高敏感位点(hypersensitive sites)，通常位于转录基因的5’和3’ 侧翼转录调控区的蛋白结合位点附近的裸露DNA上。 常染色质（euchromatin） 组成性异染色质 （constitutive heterochromatin） ： 所有细胞，整个细胞周期都存在的异染色质。其DNA不含基因，因而一直保持凝聚状态。 兼性异染色质（facultative heterochromatin）： 在特定细胞，生长发育的特定阶段，由常染色质凝聚转变成的异染色质。 染色质重塑（chromatin remodeling） 通过改变基因的启动子和调节序列区域的染色质结构来调节基因的表达，称为染色质重塑 ,也称为核小体重塑 (nucleosome