课内生物信息学复习要点.docVIP

一、名词解释（每小题3分，共30分） 生物信息学 数据库技术 数据仓库 EST 概念性翻译 同源性 单系类群 全局排列 基因作图 10．直系同源体簇 二、填空题（每空1分，共10分） 生物信息学主要研究的两种信息载体是 和 。 国际上的三大核苷酸序列数据库分别是 、 和 。 数据挖掘的三大技术支柱是 、 和 。 相同类型核苷酸的替换称为 ，不同类型核苷酸的替换称为 。 三、单项选择题（每小题1分，共10分） 1. 在对模式生物进行全基因组的测定中，作为真菌模式生物的是 。 A、大肠杆菌 B、青霉菌 C、酵母菌 D、线虫 2．NCBI成立于 。 A、1988年 B、1989年 C、1990年 D、1992年 3．根据数据库管理系统所支持的基本数据模型的不同，可以将数据库分为五类，其中第二代数据库是 。 A、层次数据库 B、网状数据库 C、关系数据库 D、分布式数据库 4．在向GenBank投送序列的工具中， 是标准的序列投送工具。 A、Cn3D B、tb12asn C、BankIt D、Sequin 5. 目前最为常用和注释最全的蛋白质序列数据库是 。 A、Identify B、OWL C、PIR D、SWISS-PROT 6. 下列选项中根据蛋白质三维折叠模式和进化关系划分的结构分类数据库是 。 A、PDBsum B、GDB C、SCOP D、CATH 7. 构建系统发生树的方法很多，其中耗时最短的是 。 A、进化简约法 B、最大简约法 C、最大似然法 D、距离矩阵法 8. 下列数据库选项中不属于蛋白质序列二次数据库的是 。 A、PROSITE B、PRINTS C、BLOCKS D、PDB 9. 在系统发生树的检验中，较为常用的方法是 。 A、MP法 B、重复取样法 C、NJ法 D、ML法 10. 下列工具中用于发现开放阅读框的软件是 。 A、Translate Tool B、ORF Finder C、Gene Wise D、E-PCR 四、多项选择题（每小题2分，共20分） 1．生物大分子携带的三种信息是 。 A、遗传信息 B、功能信息 C、调控信息 D、进化信息 2. 为实现3个抽象级别间的数据转换，DBMS提供的两层映射是 。 A、外模式/概念模式映射 B、外模式/内模式映射 C、概念模式/内模式映射 D、概念模式/外模式 3. 数据挖掘和知识发现一般可用于发现 。 A、广义知识 B、关联知识 C、聚类知识 D、预测性知识 4．用于检测DNA序列中潜在的CDS的几种特征是 。 A、ORF长度 B、Kozak序列 C、密码子用法 D、密码子使用偏性 5. 下列数据库选项中属于蛋白质结构二次数据库的是 。 A、DSSP B、FSSP C、Profiles D、HSSP 6. 下列选项中属于整合生物信息学数据系统 。 A、SRS B、Entrez C、Genera D、FLYBASE 7. 公用的EST的分析工具有 。 A、序列相似性查询 B、序列分类 C、序列组装 D、序列聚类 8. 根据有无外类群，可以将系统树分为 。 A、有根树 B、无根树 C、基因树 D、标度树 9. 在构建系统发生树的软件包中，基于最大似然法的构树软件包是 。 A、MOLPHY软件包 B、TreeView软件包 C、PAML软件包 D、PUZZLE软件包 10. 双向凝胶电泳技术的双向是指 。 A、正向 B、等电聚焦 C、反向 D、SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 五、问答题（第1、2、3题每小题6分，第4题12分，共30分） 1．简述蛋白质组分析的主要过程和关键技术？ 2．比较BLAST系列软件。 3．简述基于计算的比较基因组学的各研究方法及其原理？ 4．请举例分析某属真菌的分子系统学研究结果并联系其各自的地理分布、生态、经纬度、海拔等信息分析其生物信息学和生态学意义。 一、名词