第四章核酸序列重点分析.pptVIP

第四章 核酸序列分析 对实验室中获得的一条新的核酸序列进行生物信息学分析是实验深入研究前的标准操作。 常规分析___以水稻瘤矮病毒RGDV基因组S8片段编码区序列为例，使用BioEdit软件进行分析 核酸序列组分分析（BioEdit、DNAMAN、 Dnastar） 分析核酸序列的分子质量、碱基组成、碱基分布等。 序列变换(BioEdit、DNAMAN 、 Dnastar） 根据分析需要，对核酸序列进行各种变换，如寻找序列的互补序列、反向序列、反向互补序列等。 限制性内切酶分析(BioEdit、DNAMAN 、 Dnastar） 确定核酸序列的酶切位点。 限制性内切酶是在许多细菌体内发现的能识别和切割外源DNA的核酸酶。细菌自身的DNA因其限制型内切酶的识别位点被相应的DNA甲基化酶所甲基化，而不被内切酶所水解。限制型内切酶的这种作用使之成为遗传工程实验的重要工具酶之一。 每一种限制性内切酶都有特定的DNA识别顺序，并且呈回文排列。确定DNA酶切位点是基因操作的必不可少的步骤，因此DNA序列分析软件包大多整合有检索酶切位点的程序。这些程序附带一个酶切位点的数据库文件，根据这个文件对序列作酶切位点的查找。 NEBcutter WebCutter Rebase Web Map Restric