实例均为笔者亲自参加或者主持的工作。-高通量数据生物信息专业.ppt

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SMS (The Sequence Manipulation Suite):是一组DNA、蛋白序列分析和格式化的软件包,以网页形式发布。 它们的分析结果是一系列HTML命令,您可以打印或保存结果,也可以用HTML语言对其进行编辑。 PredictProtein:Protein sequence analysis, and structure prediction. GeneScan: 著名的分析genomic DNA中的基因序列的软件。 RepeatMasker: 重复序列屏蔽 其他引进并安装调试好的软件包(续) Cross_match/Consed/phred/Phrap/phd2fasta: 直接读取测序图,并去除测序结果中的载体部分,进行Contig 组装的软件包。 Primer 3: 基于web的PCR引物设计软件。 sim4: EST的染色体定位软件。 HMMER: 运用隐藏马尔可夫链模型(HMM)建立多序列比对模型,并以此到数据库中寻找另外的家族序列。 ClusterW/X: 多序列比对工具软件。 Artemis: DNA序列查看及注释工具软件。 BioPerl: 生物学分析用的公共Perl模块。 其他引进并安装调试好的软件包(续) 肿瘤生物信息学平台简介 数据库平台 自主开发的综合分析体系 自主开发的其他独立功能软件 其他引进并安装调试好的软件包 平台

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