生物信息学第四章序列比对与算法.ppt

系统发生软件 Joe Felsenstein‘s list (JFs list)of Phylogeny ProgrAms (最全的列表) http://evolution.gs.wA/phylip/softwAre.html JFs list(简介:包含309种软件) 三种分类依据 软件所使用的方法 软件使用的系统 软件所分析的数据 其他列表 最近加入的软件 最近更新的软件 以前列出但已经不再发行的软件 等待加入的软件 不被列出的软件 其他系统发生软件的列表 GenerAl-purpose pAckAges 一般目的 11 PArsimony progrAms 简约法 37 DistAnce mAtrix methods 距离矩阵 65 ComputAtion of distAnces 计算距离 58 MAximum likelihood And BAyesiAn methods 最大似然、贝叶斯 77 QuArtets methods 四重奏 11 ArtificiAl-intelligence And genetic Algorithms methods 人工智能、遗传算法 4 InvAriAnts (or EvolutionAry PArsimony) methods 不变量/进化简约 4 InterActive tree mAnipulAtion 24 Looking