第2章蛋白质组成及结构汇总.ppt

* Hubei University * ③β螺旋模体 许多平行的β-pleated sheet在肽链中依次卷曲，形成宽大的螺旋圆柱构象 首先在细菌的果胶裂解酶C(pectatelysase)中发现，该酶中3条β-pleated sheet围成螺旋，直径达0.17-0.27nm，共有7圈右手螺旋 有些细菌的碱性蛋白酶，噬菌体P22尾刺蛋白中也有 * Hubei University * 噬菌体P22尾刺蛋白 果胶裂解酶C * Hubei University * 4、结构域和功能域 * Hubei University * 一条肽链卷曲折叠形成的一个或几个紧密包装的稳定结构 由α-helix、β-pleated sheet、 β-turn和random coils以多种方式组合而成 可由某肽段的连续的氨基酸残基组成，也可由来自不同肽段的残基组成 结构域之间常形成裂隙，是蛋白质优先被水解的位置 酶的活性中心常位于结构域的界面上 有时结构域就是蛋白质的一个功能域 ①结构域 * Hubei University * 结构域的出现不是偶然的 （1）从动力学角度，折叠成几个相对独立的区域比直接折叠成完整的空间结构更为合理； （2）从功能角度，酶的活性中心位于结构域之间，比较自由，有利于活性中心与底物的结合。 * Hubei University * * Hubei University * ②功能域 1.功能域是蛋白质分子中能独立存在的功能单位。它可以由一个或几个结构域组成。这些结构域可以位于一条多肽链上或者几条多肽链上 。 2.活性部位是蛋白质分子的功能域 3.不同的功能域，各自具有特殊的生物功能 * Hubei University * ③结构域分类 根据结构域中二级结构的种类、数量以及排布，可以将结构域分成5种类型 α- 螺旋域 结构域中所含的结构单元主要是α- 螺旋，例如：木瓜蛋白酶的结构域1 2. β - 折叠域 结构域主要由反平行β - 折叠构成，例如：木瓜蛋白酶的结构域2 * Hubei University * 3. α＋β域 这种结构域由α- 螺旋和β- 折叠股不规则堆积而成，例如：乳酸脱氢酶结构域2 4. α／β域 结构域的中央主要是β- 折叠片，周围是α- 螺旋。α一螺旋与β - 折叠股交替排布。例如：乳酸脱氢酶结构域1 5. 无α- 螺旋和β- 折叠域 结构域不具有或仅具有少量的α- 螺旋和β - 折叠。例如：麦胚凝集素 * Hubei University * 木瓜蛋白酶的结构域 * Hubei University * 四、蛋白质的四级结构 寡聚体蛋白质中，各亚基的空间排布及各亚基间的相互作用。 主要作用力：疏水作用 多数蛋白由多个亚基结合完成其功能，如：E.coli DNA POL III，G蛋白借亚基的解离与缔合来调节自身的结构和功能 1、概念 * Hubei University * 蛋白质聚合成四级结构具有优越性 四级结构便于蛋白质执行更为复杂的功能 可以通过相同或不同亚基之间的协同作用，以实现对酶活性的调节 可以把代谢途径中的各种酶分子集合在一起，以提高催化效率 * Hubei University * 2、亚基排布 电子显微镜和X射线衍射结构分析法 在寡聚蛋白分子中，亚基的排布方式主要有两种 1．循环对称（Cn） 2．二面体对称（Dn） * Hubei University * 四级结构的结构模型 * Hubei University * 循环对称（Cn） 亚基排布在圆周上 ，有二聚体 、三聚体、四聚体、五聚体、六聚体 由二个亚基构成，具有 C2对称性。即：每个亚基沿中轴旋转180°（360°÷2），就可以与另一个亚基完全重合，如：固氮酶铁蛋白、乳球蛋白、前白蛋白、醇脱氢酶等 由3个亚基构成，具有 C3对称性。即：每个亚基沿中轴旋转120°（360°÷ 3）就能与另一个亚基重合。如：细菌叶绿素蛋白、捕光叶绿素蛋白等 * Hubei University * 由4个亚基构成，具有C 4对称性。即：每个亚基沿中轴旋转90°（360°÷ 4）便可以与另一个亚基重合，如：固氮酶钼铁蛋白、丙酮酸羧化酶及色氨酸酶等 由5个亚基构成，具有C5对称性。 由6个亚基构成，具有C6对称性 * Hubei University * 二面体对称（Dn） 具有D2对称性，即4个亚基按正四面体方式排布，如：血红蛋白、乳酸脱氢酶、醛缩酶等 具有D3对称性。分为D3正三角形（如：天冬氨酸转氨甲酰酶的6个催化亚基的排布）和 D3正八面体 十二聚体：12个亚基位于六角锥体的各个顶点，属于D6对称排布，如：谷酸胺合成酶等 * Hubei Universit