分子生物学 核酸的结构与功能.pptxVIP

第二章 DNA和RNA的结构第一节 核酸的化学组成与结构核酸 核苷酸核苷酸 核苷 磷酸核苷 碱基 戊糖 一、核苷(nucleoside)由碱基与戊糖通过N—糖苷键连接而形成的。游离形式存在于细胞中。 (一)碱基嘌呤腺嘌呤(A)鸟嘌呤(G)嘧啶胞嘧啶(C)胸腺嘧啶 (T)尿嘧啶(U) 稀有碱基， 定量分析----碱基对波长为260nm的紫外线有最大光吸收；减色效应----碱基堆积力使核酸形成稳定的三维结构；将杂环内的共轭键遮蔽起来所造成。 (二)戊糖D—核糖核糖核酸(RNA)D—2脱氧核糖 脱氧核糖核酸(DNA)RNA不如DNA分子稳定C-2上连有1个羟基二、核苷酸核苷酸核苷的戊糖上C—5位的羟基与1个磷酸基团以酯键连接二磷酸核苷酸三磷酸核苷酸环腺苷酸(cAMP)或环鸟苷酸(cGMP) 三、核酸的结构核苷酸通过3′，5′—磷酸二酯键连接成无分支的线性大分子骨架由戊糖与磷酸基团组成 每股核酸链都有5′和3′两个的末端，习惯上按照5′---3′的方向书写。第二节 DNA的结构一、研究历史1928年，Griffith的肺炎球菌转化实验1944年，Avery等人指出脱氧核糖核酸是导致肺炎球菌转化的基本单位”1951年，Herriott发现噬菌体T21952年，Hershey和Chase为此用32P和35S进行了同位素掺入实验1950年，Chargaff提出DNA分子的碱基组成是有规律的1951年，Wilkins发现这DNA分子是由2条链组成的螺旋结构1953年， Watson和Crick提出DNA结构的双螺旋模型 二、DNA的结构一级结构核酸分子中核苷酸的线性排列顺序二级结构双螺旋结构其他高级结构分子规律地压缩 (二)DNA的二级结构模型Watson-Crick模型DNA分子是由两条反向平行的多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕形成的右手螺旋直径2nm，每环绕一周升高 3.4nm，两个相邻碱基对之间相距0.34nm，每周都由10个碱基对形成。Watson-Crick模型磷酸与核糖组成的骨架位于双螺旋的外侧，碱基位于内侧。上下相邻的碱基平面相互平行，且与中心轴垂直。核糖平面与中心轴平行。 两条反向平行链的稳定性由疏水相互作用和众多氢键来维持。Watson-Crick模型 位于同一平面上的两个碱基间的配对是有规律的，其中A与T通过两对氢键配对，G与C通过三对氢键配对。碱基对互补原则(base—pair complementarity)是碱基的大小、形状和化学组成共同限定的结果。Watson-Crick模型DNA分子的双螺旋结构形成大小不等的两条螺旋形凹沟。较大的1条称大沟(major groove)，较小的一条称小沟(minor groove)。 每个碱基都会有一部分在此区域“暴露”出来，以便与其他的DNA结合分子相接触。DNA构象种类1、B构象Watson-Crick模型，是DNA结构的平均特征2、A、C、D、E、Z构象3、构象变化的因素自身特定的碱基序列周围环境条件 A构象特征每一螺旋有11个碱基对显得比B-DNA短粗部位DNA.RNA杂交链单链RNA的局部互补双链Z构象1979年Rich等发现特征二级结构更为细长左手螺旋的DNA具有独特的锯齿形(Zig—Zag)骨架 Z—DNA的生物学意义 ① 影响DNA的超螺旋状态，影响 DNA与其他分子的结合状态，影响基因活性。 ② 有利于调节蛋白识别并结合于特定的核酸序列 Z—DNA参加真核生物染色质结构的形成 所有基因的增强子均含有形成Z—DNA的序列DNA二级结构的维持1．氢键G-C的配对强度高于A—T维持 DNA分子结构的稳定性 2.碱基堆积力实质是疏水相互作用和范德华引力维持DNA的二级结构起重要作用。DNA二级结构的破坏（变性） 1、DNA变性因素加热pH值变化有机溶剂 (尿素、酰胺) 2、DNA变性的用途3、增色效应DNA变性后在260nm处的紫外光吸收将增强(三) DNA的三级结构 DNA的三级结构的定义是指双螺旋结构基础上的卷曲 包括线状双链的扭结和超螺旋、多重螺旋单链形成的环环状DNA中的扭结、超螺旋和连环 三级结构的普遍形式环形DNA双螺旋链进一步盘绕形成的超螺旋。DNA封闭环状结构真核DNADNA结合蛋白组成的支架使DNA形成许多连续的环状功能单位。原核DNA1．环形DNA的拓扑学特性(topology)(1)连环数(1inking number)以L表示,指双螺旋中两条链相互缠绕的次数 (2)缠绕数(twisting number)用T表示,是指DNA分子中Watson-Crick螺旋的数目。 (3)超螺旋周数(writhe／number of turns of superhelix) 以W表示, W ＝ L－T超螺旋