第九章蛋白质结构与功能预测.pptVIP

蛋白质结构与功能预测 平均疏水值 预测的跨模螺旋区域 两种跨膜Helix 预测区域的螺旋示意图 平均疏水值 预测的跨模螺旋区域 两种跨膜Helix * 亲疏水轮廓 跨膜蛋白序列“边界”原则 -Landolt Marticorena et al., 1993 胞外末端－Asp、Ser和Pro 胞外-内分界区域－Trp 跨膜区－Leu、Ile、Val、Met、Phe、Trp、Cys、Ala、Pro和Gly 胞内-外分界区域－Tyr、Trp和Phe 胞内末端－Lys和Arg 两股或两股以上α螺旋相互缠绕而形成超螺旋结构 存在于多种天然蛋白质中，如转录因子、结构蛋白、膜蛋白中，在生物体内执行着代谢调控、分子运动、膜通道、分子识别等重要的生物功能， * 蛋白质卷曲螺旋域分析 典型的有亮氨酸拉链，存在7残基 重复结构（heptad repeat)，以a，b， c，d，e，f，g位置表示，其中a和d位置为疏水性氨基酸，而其他位置 残 基为亲水性 COILS- /software/COILS_form.html PEPCOIL- http://bioweb.pasteur.fr/seqanal/interfaces/pepcoil.html 蛋白质卷曲螺旋域分析 工具 网站 备注 Coils /software/