二联体伪氨基酸成分的药物-GPCR靶标结合软件设计讲稿.doc

景德镇陶瓷学院 本科生毕业设计（论文） 中文题目：二联体伪氨基酸成分的药物-GPCR靶标结合软件设计 英文题目： DRUG TARGET TWO CIS-GPCR PSEUDO AMINO ACID COMPOSITION COMBINEDWITH SOFTWARE DESIGN 院 系： 专 业： 姓 名： 学 号： 指导教师： 完成时间：  摘 要 摘要 参与许多疾病如癌症，糖尿病，神经退行性，炎症和呼吸道疾病，G蛋白偶联受体（GPCRs）是治疗药物中最常见的目标。它是费时和昂贵的确定是否药物和受体之间的相互作用是在蜂窝网络中纯粹的实验技术手段。虽然一些计算方法在这方面的知识的基础上开发的3D（三维）的结构蛋白，不幸的是他们的使用非常有限，因为大多数的G蛋白偶联受体的三维结构是未知的。为了克服这种情况，一个基于序列的分类器，被称为“igpcr药”，是在蜂窝网络的G蛋白偶联受体与药物的相互作用预测。在预测中，该药物组合物由2D（二维）制定通过256d向量的指纹，通过PseAAC（伪氨基酸组成）受体与灰色模型理论的产生，并预测发动机由模糊K近邻算法操作。此外，为igpcr药物一个用户友好的Web服务器是建立在http：／www.jci-bioinfo CN / igpcr药物。对于大多数实验科学家便利，一步一步的指导是提供如何使用Web服务器不需要遵循本文只是对其完整性的复杂的数学方程，获得期望的结果。总体成功率的igpcr药物通过Jackknife检验达到了85.5%，这是高于率由现有同类方法2010虽然没有Web服务器是否建立了它。预计igpcr药物可能会成为一个有用的高吞吐量的工具和药物开发的基本研究，和这里介绍的方法也可以扩展到其他药物–靶相互作用网络的研究 关键词：g-protein-couple受体（GPCRs） 灰色模型 分子指纹图谱 模糊K近邻算法 伪氨基酸组成 igpcr药物Abstract Involved in many diseases such as cancer, diabetes, neurodegenerative, inflammatory and respiratory disorders, G-protein-coupled receptors (GPCRs) are among the most frequent targets of therapeutic drugs. It is time-consuming and expensive to determine whether a drug and a GPCR are to interact with each other in a cellular network purely by means of experimental techniques. Although some computational methods were developed in this regard based on the knowledge of the 3D (dimensional) structure of protein, unfortunately their usage is quite limited because the 3D structures for most GPCRs are still unknown. To overcome the situation, a sequence-based classifier, called “iGPCR-drug”, was developed to predict the interactions between GPCRs and drugs in cellular networking. In the predictor, the drug compound is formulated by a 2D (dimensional) fingerprint via a 256D vector, GPCR by the PseAAC (pseudo amino acid composition) generated with the grey model theory, and the prediction engine