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第7章遗传标记卢2.ppt

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第7章遗传标记卢2

母亲 儿子 男性1 男性2 男性3 不同个体有不同的指纹 STR分型技术流程 银染显带 检材DNA提取 PCR扩增 聚丙烯酰胺凝胶电泳分离 荧光染料显带 基因型分析 DNA指纹技术基本流程图 STR分型银染分析结果 CSF D13S796 D16S3391 GAB AF S M AF S M AF S M AF S M 几种常用的荧光标记复合扩增系统 试剂盒名称 基因座数 基因座名称 平均匹配概率 AmpFISTR Profiler 10 Amel,VWA,FGA,D3S1358,D5S818,D8S1179, D7S820,D21S11,D18S51,D13S317 1/9.6×1010 PowerPlex1.1 9 Amel,D16S539,D7S820,D13S317,D5S818, CSF1PO,TPOX,TH01,VWA 1/1.2×108 AmpFLSTR plus 10 Amel,D8S1179,D21S11,D18S51,D13S317, D7S820,D5S818,D3S1358,VWA,FGA 1/1.8×109 PowerPlex16 16 Amel,CSF1PO,FGA,TPOX,TH01,VWA, D3S1358,D5S818,D7S820,D8S1179,D13S317,D16S539,D18S51,D21S11,PentaD,PentaE 1/1.8×1017 基因座 排除概率 累积排除概率 基因座 排除概率 累积排除概率 TPOX 0.302 0.302 TH01 0.326 0.997262808 D3S1358 0.510 0.6580 VWA 0.540 0.998740892 FGA 0.635 0.87516 D13S317 0.593 0.999487543 D5S818 0.683 0.960427 D16S539 0.409 0.999697137 CSF1PO 0.413 0.9767704 D18S51 0.667 0.999899146 D7S820 0.445 0D21S11 0.667 0.999966415 D8S1179 0.685 0.995938885 汉族群体13个STR非父排除概率 基因座 母方突变观察值 母方突变率(%) 父方突变观察值 父方突变率(%) D1S80 2/13 770 0.015 44/127 633 0.035 HUMVWA31 1/4 197 0.024 444/118342 0.375 D17S5 0/228 <0.439 7/6568 0.107 CYP19 6/343 1.75 104/110 417 0.094 ACTBP2 0/330 <0.302 312/44 297 0.704 D7S820 0/638 <0.157 8/4 957 0.161 D13S317 0/631 <0.159 1/759 0.132 D5S818 0/1 174 <0.090 4/2 091 0.190 HUMLIPOL 0/312 <0.350 1/693 0.141 D18S849 0/4 143 <0.025 11/5 368 0.205 D12S1090 7/4 019 0.174 43/5 272 0.816 D3S1744 4/4 146 0.097 29/5 378 0.539 D9S302 5/2 663 0.188 12/2 611 0.460 D22S683 2/2 670 0.075 9/2 625 0.343 D18S535 1/2 676 0.037 2/2 624 0.076 常见法医VNTR及STR遗传标记的突变率 STR(Short tandem repeats) 如D5S818: 5’GGGTGATTTTCCTTTTGGT(AGAT)7-14TGTGGCTATGATTGGAATCA3’. 目前实验室鉴定常使用STR基因座有:TH01、VWFA31、TPOX、CSFIPO、FIBRA、DS1358、D7S820、D8S1179和D5S818。 基因座 个体识别几率 累积个体识别几率 TPOX 0.789 0.789 D3S1358 0.856 0.9696 FGA 0.952 0.99854 D5S818 0.912 0.999872 CSF1PO 0.858 0.9999818 D7S820 0.917 0D8S1179 0.950 0.999999924 T

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