基于R的群落学多元统计解剖.ppt

* * 第一主成分代表海拔高度，第二主成分代表坡向 * 除趋势对应分析(Detrended correspondence analysis, DCA)： CA采用单峰曲线表示物种和环境关系 CA产生的弓形效应 CA的第二排序轴在许多情况下是第一轴的二次变形，即所谓的“弓形效应”（Arch effect）或者“马蹄形效应”（horse-shoe effect）。 （详见张金屯《群落生态学》168页） × 和?分别代表除趋势前和除趋势后的样方排序 （引自Hill 和Gauch 1980） DCA在R中的实现采用函数decorana。 decorana(veg, iweigh=0, iresc=4, ira=0, mk=26, short=0, before=NULL, after=NULL) veg:群落数据; iweig:稀有物种的权重；(稀有物种影响比较大） iresc：纠正弓形效应的次数； ira:分析的类型(DCA:0 , CA:1); mk：校正弓形效应轴的分段数; short: 需要校正的最短梯度。 plot(decorana(gtsdata)) plot(cca(gtsdata)) 直接梯度分析（Direct Gradient Analysis） ： RDA (Redundance analysis) CCA (Canonical correspondence