DNA启动子、终止子教程范本.ppt

如何分析基因序列中的启动子、外显子和内含子 生命科学学院 ?启动子：RNA聚合酶特异性和结合的DNA序列。 启动子是基因的一个组成部分，控制基因表达的起始时间和表达的程度。 ?外显子：断裂基因中的编码序列。外显子是真核生物基因的一部分，它在剪接后仍会被保存下来，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。 ?内含子：断裂基因的非编码区，可被转录，但在mRNA加工过程中被剪切掉，故成熟mRNA上无内含子编码序列。 怎样利用互联网中的网站或软件分析该序列中的外显子、内含子和启动子呢？ 现有人基因组中的一段序列GGTATGGGGCCAAGAGATATATCTT……….. 一、根据一段碱基序列找到其对应的基因名或其序列号 任选浏览器——搜索“NCBI”——找到后点击进入，出现如上界面——点击“BLAST”（Basic Local Alignment Search Tool, BLAST） 当出现如上界面时，点击“nucleotide blast” 打开页面后，在检索框中输入需要查找的序列，如图所示 根据索要查询的基因来源，选定需要查询的基因（人类基因）——点击“BLAST”打开 出现页面后向下滑动直至出现图1 寻找Ident(一致性）最高的一项 点击进入 点击进入后见 所查序列名称 以及序列号 据此进行操作 二、已知基因的基因名或序列号找到其启动子、外显子和内含子 1、输入网址进入UCSC网站 2、点击Genome Browser 3、点击进入后可看到以下页面 （1）选择是何种生物的基因（如人类，老鼠等） （2）输入你所需要查询的基因名称 输入完毕，点击SUBMIT 4、可看到以下页面 （1）将Ensembl Genes设置为dense（显示） （2）点击refresh 5、可看到以下页面 找到Ensembl Genes 点击所对应的序列图形 6、可看到以下页面 继续点击所对应的序列图形 7、可看到以下页面 选择Genomic Sequence 8、可看到以下页面 （2）选择表现形式（如外显子大写，其余都小写） （1）根据需要选择所要展现的内容（如外显子、内含子） （3）点击submit