《Interleukin-4的生物信息学分析论文》.docVIP

目 录 摘 要 1 关键词 1 Abstract. 1 Keywords 1 前 言 1 1 材料与方法 1 1.1 Interleukin-4蛋白序列的获取 1 1.2 Interleukin-4蛋白序列比对及多重聚类分析 2 1.3 Interleukin-4 蛋白理化性质及结构分析 2 2 结果与分析 2 2.1 Interleukin-4蛋白信息的获取 2 2.2 Interleukin-4蛋白序列获取及比对分析 3 2.3 Interleukin-4蛋白理化性质分析 3 2.4 Interleukin-4的亲疏水性分析 4 2.5蛋白质信号肽的预测 4 2.6 跨膜结构域的预测和分析 5 2.7 Interleukin-4的二级结构预测 5 2.8 Interleukin-4蛋白的三维结构构建 6 3 结论 7 参考文献 7 Interleukin-4的生物信息学分析 学生姓名：尹玲 学号：20105071101 学院：生命科学学院 专业：生物科学 指导老师：宋强 职称：副教授 摘要：白细胞介素4（Interleukin-4）由抗原或丝裂原刺激的cd4+t细胞产生，是18～19kd的糖蛋白，能刺激活化B细胞和T细胞增殖、 调节体液免疫和适应性免疫中起关键作用[1-2]。本文通过生物信息学手段从数据库中检索到几种白细胞介素4的蛋白氨基酸序列信息，再以此为例，用各种软件对其进行多方面的分析和预测，希望能为白细胞介素4的防治和治疗以及研究该蛋白的潜在功能提供理论基础[3-4]。 关键词：白细胞介素；生物信息学；糖蛋白 Abstract：Interleukin-4 (Interleukin-4) from the antigen or mitogen-stimulated cd4 + t cells, is 18 ~ 19kd glycoprotein can stimulate the activation of B cells and T cell proliferation, humoral immunity and adaptive immune regulation play a key role. Through bioinformatics retrieved from the database to several interleukin-4 amino acid sequence information, and then thought out, many of them with a variety of software analysis and forecasting, hoping to interleukin-4 Prevention and treatment, and research potential function of this protein to provide a theoretical basis. Keywords: ?interleukin;?biological cytology;?glycoprotein 前言 21世纪初,已经发现29种白细胞介素,分别被命名IL - 1至IL – 29[5]。白介素4是II型辅助T细胞分泌的细胞因子[6]。白细胞介素- 4的生物学效应,包括刺激激活的T细胞和B细胞增殖,T细胞分化成II型辅助T细胞[7]。它在调节体液免疫和获得性免疫中发挥重要作用[8]。白细胞介素-4诱导B细胞抗体类别转向IgE，上调第二型主要组织兼容性复合体的产生。这一因子是由M.霍华德、W.保罗和E.委特塔（Vitetta）在1982共同发现的[9]。 1 材料与方法 1.1 Interleukin-4蛋白序列的获取 登录NCBI主页进Entrez网页( /sites/gquery )，在“Search NCBI databases”对话框栏中输入检索词“Interleukin-4 ”， 单击search 检索[10-12]。Protein 数据库命中2875条记录。点击“Protein: Protein sequences ”进入数据库。对命中的2875条记录进行条件限制，在“Source database”栏下拉菜单中选择“UniProtKB/Swiss-Prot”，降低检索的冗余度。结果显示有77条记录进入结果，从结果中选择8种不同来源的Influenza virus protein，选择Fasta单击打开序列页面，依次将其序列保存至IV.txt文件中。 1.2 Interleukin-4蛋白序列比对及多重聚类分析 打开Clustal 2.1，利用“File”菜单中的“Load Sequences”，打开保存有I