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第四部分:酶动力学分析及活性调节(赵武玲老师) ---橄榄枝整理酶的化学本质酶的化学本质:绝大多数的酶是具有催化活性的蛋白质,有些RNA也具有催化活性(称为核酶)。酶与其它催化剂的共性:a催化效率高;b只改变化学反应的速度,不改变化学反应的平衡;c降低反应所需的活化能酶作为催化剂的特性:a比非酶催化剂效率高;b作用条件温和;c具有高度专一性;d受严格调控酶的分类:根据结构特点分:3种单体酶(只含一条多肽链);寡聚酶(含2条或2条以上);多酶体系(几种酶比此嵌合形成的体系)。根据酶的化学组成可以分为:2种单成分酶;双成分酶:酶蛋白和辅因子(辅酶和辅基),同时含有酶蛋白质和辅因子的双成分酶叫作全酶。双成分酶中:酶蛋白决定反应的专一性,辅因子co-factor决定反应的性质:辅基:与酶蛋白结合较为牢固,不易分离;辅酶:与酶蛋白结合较为松弛,易分离。其无严格界限酶的活性中心:(三个要点:定义、组成/结构、共同特征)a定义:酶的活性中心是酶分子上直接与底物结合,并进行催化作用的部位。包括两个部位:结合部位:酶与底物结合的部位,决定酶的专一性;催化部位:参加催化的部位,决定酶的催化能力。b组成/结构: 单成分酶的活性中心由酶蛋白上的少数几个氨基酸组成。双成分酶中,除了酶蛋白上的几个氨基酸,辅基或辅酶分子上的某一部分往往也参与活性中心的组成。活性中心的基团都是必需基团。c. 酶活性中心的共同特征: (1)活性中心只占酶分子中很小的一部分;(2)活性中心具有三维结构;(3)活性中心由疏水氨基酸形成口袋,极性氨基酸参与反应;(4)底物靠弱键与酶结合。6. 酶的命名与分类:国际分类编号系统(六大类,顺序不可颠倒)1.氧化还原酶类2.转移酶类3.水解酶类4.裂合酶类5.异构酶类6.连接酶类国际分类编号方案:第一个数字:酶的类别;第二个数字:酶的亚类;第三个数字:酶的亚-亚类第四个数字:酶在亚-亚类中的排序;编号前冠以EC,是国际酶学会缩写,如EC 4.1.1.17. 合酶与合成酶:合酶是催化加成反应的裂合酶;合成酶是反应需要ATP的参与,属于连接酶类。8.酶作用的专一性:结构专一性:键专一性、基团专一性、绝对专一性;立体异构专一性:旋光异构专一性、几何异构专一性。9. 酶作用专一性的假说--诱导契合学说:酶与底物在相互作用过程中,底物诱导酶活性中心发生构象变化,底物分子中的敏感键产生张力并“变形”。10. 酶活力是酶催化一定化学反应的能力。表示方法:酶促反应速度、酶的活力单位酶促反应速度:单位时间内,底物的消耗量或是产物的生成量。通常是测定反应的初速度。1个酶活力单位,是指在特定条件下,在1min内转化1μmol底物的酶量,或是转化1μmol底物的有关基团的酶量。1 IU = 1μmol?min-11个Kat是指在特定条件下每秒钟催化1mol底物所需的酶量。1 Kat = 1 mol?s-1酶的比活力Specific activity 反映了酶的纯度。单位:U /mg U-酶的活力单位,mg-蛋白质含量酶的分离纯化方法与蛋白质的分离纯化方法相似,在分离纯化过程中,要注意:必须保持酶的活力,必须随时跟踪酶的活力。酶促反应动力学1.米氏方程KM : 米氏常数,即酶促反应速度达到最大反应速度一半时的底物浓度。 V=1/2Vmax时,Km=[S]2.kcat表示当酶被底物饱和时,每秒每摩尔酶分子将底物转换成产物的摩尔数。Kcat=Vmax/[E]T3.米氏方程应用:(1)要求反应速度v达到Vmax的99%,其底物浓度应为: v= Vmax[S] /(KM+[S]) 99% Vmax = Vmax[S] /(KM+[S] )99% × (KM+[S])= [S] [S]=99 KM(2) 已知某个酶的[S]=3KM,求反应速度v相当于Vmax的百分率。 v = Vmax[S]/ (KM + [S]) v = Vmax· 3 KM / (KM + 3 KM ) v = ? Vmax v = 75% Vmax(3)双倒数作图法例:一个酶促反应中,反应速度与底物浓度的值如下:[S] (mmol· L-1): 2.0 3.3 5.0 10.0v (mmol· L-1 min-1): 2.5 3.1 3.6 4.2(1)请用双倒数作图法计算KM和Vmax并画图。(2)如果酶的浓度为4×10-5 mmol· L-1,请计算kcat(提示:kcat是每秒每个活性中心的反应速度,单位是s-1)。3.三种可逆的抑制作用比较:竞争性抑制作用、非竞争性抑制作用、反竞争性抑制作用不可逆抑制作用:有机磷化合物、有机汞、有机砷化合物、氰化物、烷化剂4. 温度对反应速度的影响:最适温度;温度升高使酶促反应速度加快,但温度升高也可使酶
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