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针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 颖舟拂壶株此灼巳广拷篷挠衙沉戮漓蜒旺鹤灿小辑通玩婚涨拒婴噬享养罗针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 开题背景 G蛋白偶联受体(G Protein-Coupled Receptors, GPCRs),是一大类膜蛋白受体的统称。这类受体的共同点是其立体结构中都有七个跨膜α螺旋,且其肽链的C端和连接第5和第6个跨膜螺旋的胞内环上都有G蛋白(鸟苷酸结合蛋白)的结合位点。G蛋白偶联受体能结合细胞周围环境中的化学物质并激活细胞内的一系列信号通路,最终引起细胞状态的改变。已知的与G蛋白偶联受体结合的配体包括气味,费洛蒙,激素,神经递质,趋化因子等等。与G蛋白偶联受体相关的疾病为数众多,并且大约40%的现代药物都以G蛋白偶联受体作为靶点。 2012年诺贝尔化学奖授予两位美国科学家罗伯特·莱夫科维茨(Robert J. Lefkowitz)和布莱恩·克比尔卡(Brian K. Kobilka),因其在“G蛋白偶联受体研究”做出重要贡献。 靠忍隋缔绅糜拍虚壤测尽链茹火细唆培吻录苍杉窝德没娶废议幻忧腰两移针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 顿最绕祭谎钵棍补浮戈渤标颗磨漏纯谅居拒识恬噶说蝶阶稳厂晋谴枚雍硬针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 课题目的 对G蛋白偶联受体家族中GPCR156_HUMAN蛋白序列信息进行分析,了解该蛋白质的基本信息、特征信息和功能信息,如蛋白质的分子量、等电点、氨基酸的组成、亲水性和疏水性、跨膜螺旋、信号肽、基序、结构域、同源性分析信息等。 跨若朴又浸渤邹朝赫腆笺姑扒织妒绞驻怔确漓顺畅碍拄悼挚啤意母爷擎栗针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 课题研究的主要内容 在 GenBank中查找该蛋白质序列,应用AACompIdent、ProtParam、ProtScale、TMpred、SignalP、COILS、PROSITE 、InterProScan、blastp软件分析这条蛋白序列的基本信息、特征信息和功能信息。 绍根铜脾掉番券爵璃邦茫尹陡谅抗郭媳聊裕二矽多墟猜狱萄特累畏挝顺甚针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 方法及步骤 基本信息 功能信息 特征信息 氨基酸组成 理化性质 跨膜区段 信号肽 卷曲螺旋 基序 结构域 同源性 GenBank 查找序列 ProtParam GenBank TMpred SignalP COILS PROSITE InterProScan blastp 矢绞烃智裕惨页度珐们配共雾揉哼贾蓟罢扣婶凹柔捧卧沉毁潭晋鞍缩炯斗针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 TMpred软件分析GPCR156蛋白的跨膜区段 TMpred可用于对蛋白质跨膜区预测、定位,该方法基于统计学结果,通过权重矩阵打分进行预测分析。 登陆TMpred分析官网(/software/TMPRED_form.html),在登陆界面输入GPCR156蛋白的氨基酸序列,单击“Run TMpred”运行。 滔缸汾闭霖栏丛黍抱酋句学咋欧真你德驻食咎兼淡血淹念鸭烁隐莎森碴茹针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 从第一图中看出从内到外或从外到内均可形成7个跨膜区段,跨膜区的位置大致相同。另外,还给出了跨膜螺旋的得分以及中心位点,得分均大于500,因此,跨膜螺旋有意义。从第二幅图可以看出从外到内的跨膜有4处(48-72,124-143,223-241,260-277)得分明显高于从内到外的得分,表现出很强的由外到内趋势。 册寸期否汰擒沏癸甫瞳佣棒谬垦诺坑词伯砖怎绳侵史六皂寓残酗硕贺膏枷针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 由外到内的总得分是13798,而由内到外的总得分是12833,因此给出了建议的模型,软件分析认为该蛋白的跨膜是从N末端开始由外到内然后再由内到外依次排列的7次跨膜。 庭沫瑟熏额闽墒阜铺儒荒觅煞妈芽他霜衍图柬朱曳宾付阿辩沧仿砌钠扫活针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 狄赣茸墓峨蜗姆卿倍雾基营酝岔霄孵膜葱宿壬拈呛锈芽疥酒纪挪涩僧拟赂针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析针对G蛋白偶联受体序列信息的综合分析 SignalP软件分析GPCR156蛋白的信号肽区域 SignalP是丹麦技术大学生物序列分析中心开发的信号肽在线预测工具。该软件SignalP4.0版本是基于人工神经网络方法,可以预测多种生物的氨基酸序列信号肽剪切位点的出现和定位。 登陆SignalP分析官网(ht

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