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- 2016-12-18 发布于重庆
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第一节 生物信息学 五、核酸序列分析 (一)DNA分析的意义 建立快速、准确的DNA序列分析方法,对于研究基因的结构和功能、揭示生命的机制具有十分重要的意义。 由于遗传密码的简并性,密码子第2位或第3位的突变有时并不改变其编码的氨基酸,因此只能从DNA水平上探测这种区别。 (二)基因结构 真核生物:基因具有不连续性,有内含子、外显子、编码区、非编码区等。 原核生物:基因结构较为简单,通常没有内含子。 第一节 生物信息学 五、核酸序列分析 cDNA序列的开放阅读框分析 基因组序列中的外显子和内含子结构分析 基因启动子及其它DNA调控位点分析 (二)基因结构 第一节 生物信息学 六、蛋白质结构分析 1. 预测蛋白质的物理性质 (1) 计算输入序列等电点和分子量 第一节 生物信息学 六、蛋白质结构分析 (2) PeptideMass对肽段分析 第一节 生物信息学 六、蛋白质结构分析 (3) Tgrease是FASTA工具包中的程序,分析蛋白质序列的疏水性。 这个程序延序列计算每个残基位点的移动平均疏水性,并给出疏水性-序列曲线,还可以发现膜蛋白的跨膜区和高疏水性区的明显相关性。 下载FASTA的网址: /pub/fasta/ 2. 蛋白质二级结构预测 第一节 生物信息学 六、蛋白质结构分析 预测的基本依据: 每一
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